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文章 重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

...用最大似然法构建进化树的软件:fasttree,iqtree2,RAxML-ng.输入的数据为做群体遗传进化得到的SNP数据。数据准备做完重测序分析后,我们可以得到包含 SNP的变异结果vcf文件作为输入文件。详见课程:重测序数据分析课程,然后...

文章 linux中qrencode生成二维码

...ng结尾。-表示输出到控制台。-s:指定图片大小。默认为3像素。-t:指定产生的图片类型。默认为PNG。可以是PNG/ANSI/ANSI256/ASCIIi/UTF8等。如果需要输出到控制台,可以用ANSI、ANSI256等。 4. 输入STRING STRING:可以是text、url等。 5. ...

问题 我想问一下,我这表格读不进去,不知道是为什么?有没有解决办法。表格内容就是24样,20家族成员的fpkm值的表格

问题 老师我200样本的重测序测完以后,构建进化树时进化树的分群信息和我样本的来源信息不同,该怎么解决呀

文章 植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

...?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一工具可以做到——Mapman! (官方网址:https://mapman.gabipd.org/)。 Mapman是一针对植物,对基因在生物体代谢途径和生物过程中的功能进行分类的工具,它采用了层次分...

文章 perl 从数组随机抽取元素

... 2 7                my @shuffled_name = shuffle('A'..'G');# F E G A B D (my$a) = @shuffled_name;  # F shuffle()作用是对对列表中的元素随机排序,我们取第一值,这样就相当于随机抽取一数组元素了。

问题 去除异常样本的标准

老师,我的29样本,聚类之后发现有四样本不太乐观,如图所示,abline=2600去除了这四样本,写文章的时候该怎么描述这里?标准是什么?图左边的Height代表什么?

文章 华为是如何绝地反击,强势崛起的?(1)

...价格也比同期的高价机型高不少。 消费者一直都愿意为更好技术和体验买单,有本事做出更好手机的厂商,拿走这钱。 去年十月发布的Mate10是标准的水桶机,各方面都不错但缺少绝对亮点。所以Mate10的销量在华为旗舰机...

问题 我一直有一问题,小麦在做家族鉴定时会有好几转录本(如.1,.2,.3等),这时候是只取.1呢,还是所有转录本都取?

问题 老师我想问一下,在鉴定基因家族成员时,可以有什么方法知道成员大概有多少吗?还是我们自己不知道,但是发文章的时候审稿人知道

问题 老师,我想问一下课程里面有课程是可以处理双通道芯片的,它是具体处理出来是怎么样的呢,是知道了每处理的表达量吗

问题 老师,您好,昨天我跟着您的视频在docker上做blast分析,但我不知道怎么从第一界面退回第二界面,请问是需要按哪按键?

问题 使用命令提取gene_exon_info.gff文件时,我的OVATE_domain_new_out_removed_redundant.txt里这一列id(图一)只有绿色箭头标的这五可以被输出(图二),是怎么回事呢?而且之前提取的IDlist(图三)也只有那五对应在mRNAID下面,其他的都发生了错位,我是手动到excel里面转换过来的,希望老师解答一下,我这是哪一步出了错误,卡在这里很久了。

文章 《Science》:中国人诚信全球倒数第一?这实验设计科学吗?

...民的诚信情况。 按道理《Science》这么牛,那刊发的这论文一定是经过层层审核,内容和实验设计一定是非常科学而严谨、得出的结论一定是精准又可靠吧? 然鹅,你们猜怎么的? 这论文最终的结论是:中国公民诚信度在...

文章 R 语言赋值运算符区别:`

...(environment hierarchy)中进行。R语言中,<- 与 = 这两赋值运算符最主要的区别在于两者的作用域不同。大家可以从下面的例子感受一下。好多好多人喜欢用的 =貌似许多早期学习R的童鞋都比较喜欢使用 = 进行赋值。毕竟...