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问题 预测启动子顺势作用原件

...信息，和我自己拿基因去NCBI寻找基因的位置出来的结果不一样而且差距很大呢？比如这个标记蓝色的基因，根据视频里出来的位置结果是2900649        2901248，而我自己找的话看到的位置是2834329   2835633，为什么会这样子呢？

问题 MCScanX运行无结果

...对比了文件也没啥问题，而且这两株菌有很高的相似性，不可能没有共线性结果，还请大家帮我看看，到底是哪里出了问题！！！！万分感谢！！！！！！

问题 共线性mcscanX绘制圈图

路径不知道到底哪里有问题啊，这块一直过不去，文件夹顺序是/home/manager/GD_HF_Mb/my_gene_family/MCScanX/mcscan/，manager,Md.gff在mcscan文件夹里，Md.collinearity在mcscan文件夹里，family.ctl在MCScanX文件夹里，2OG_box_family.txt在MCScanX文件夹里，

问题 Fst与Pi联合，筛选受选择区域

老师，您好。我再用vcftools计算Fst和Pi时，设置的窗口步长是一致的，但是跑出来的结果有一些区域出现了跳过的情况，导致两个文件的窗口不一致，如图所示，pi值的范围直接从15w到了50我，怎么解决这一问题呢？

问题 请问如何预测基因家族蛋白的二级结构？

...无关的问题，新版的参考基因组和旧版的基因ID表达方式不一样了，请问新旧版的ID怎么对应呢？

问题 基因家族成员鉴定cdd

...是保证有STK，丝氨酸和组氨酸的这个基序在。所以有些搞不清楚

文章 利用sed 命令去掉windows下回车符

在Windows中文件的换行符与linux中是不同的，其在linux中显示为^M，在使用脚本处理时并不希望有这个符号，所以需要去掉此符号，其方法如下： sed  -i 's/^M//g'  test.txt    ^M 是回车换行符,输入方法是按住CTRL+v,松开v,按m

文章 利用Python matplotlib库对基因组同源区域和进化速率进行可视化展示！！！

相关软件：ColinearScan、Python、BioPerl、BLAST 分析流程： 1、下载人类、猕猴、树鼩（参考物种）基因组数据，利用Python语言对基因组数据进行处理。 2、利用BLAST进行序列比对，或者基因组之间的同源信息。 3、利用强大的Colinear...

问题 GEO下载lncrna芯片注释问题

...者是Platform GPL19615 这个平台也是无法出现正常gene symbol，不知道是否是因为lncrna，或者mirna的原因。

问题 物种分类树图

...e/pick_de_novo_otus/otu_table_clean_rare.txt”（数据见图3），也看不出有什么问题，不知道是什么原因导致了无法进行分组group。

问题 提取可靠基因家族成员的结构域序列

运行代码如下 cat ../id.txt|while read ind;do grep -f ./check/${ind}.WRKYgene.list ${ind}.WRKY_hmmerOut.cut_e_len.txt > ${ind}.WRKY_hmmerOut.final.txt done 不提示报错但输出文件没有东西。 输入文件如下

文章 exp_immu_cor_plot.r 基因表达量与免疫侵润相关性绘图分析

使用方法： $Rscript ../scripts/exp_immu_cor_plot.r -h usage: ../scripts/exp_immu_cor_plot.r [-h] -e expset -i immu [-m method] [-a alternative] [-n ncol] [-l] [-x label.x.npc] [-y label.y.npc] ...

问题 利用MeV绘制基因热图时出现问题

...档的分隔符制图，上传时候并没有默认第一列为基因ID，不显示紫色背景，显示There is no spot data available，请问这个问题怎样解决？

问题 tassel 画进化树报错

... supergene.phy -format Phylip_Intersupergene.phy文件晒出的核酸序列不唯一

文章 基于R实现统计中的检验方法---T检验

...验正是以t分布作为其理论依据的检验方法。后面的方差分析，其独立样本T检验的前提条件是相同的，即正态性额方差齐性。(参考：t检验和方差分析的前提条件及应用误区_百度文库（链接见文末）说的非常详细) 2.分类 单总T...