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文章 生命大数据

...赠给光基金。前200名注册参会人员将获专属礼品一套,先先得。   会议日程|三大主题解读新纪元   生物技术(BT)和信息技术(IT)的融合,云计算的风起云涌,将我们带入了一个解读生命密码、认识疾病本源、重新...

文章 关于CodeML分析中四种常见模型假设

...同位点的和不同支系间受的ω均存在差异(既考虑位点间考虑支系间的 ω 值),共有四个模型Model A、Model B、Model C和Model D,主要参数如下: (1)Model A (Model 2, NSites=2, ncatG=ignored) (2)Model B (Model 2, NSites=3, ncatG=ignored) ...

文章 R语言计算平均值,中位数

...值。此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下:1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点...

文章 进化树中bootstrap值设置

...show/hide bootstrap scores” 打开bootstrap值的显示开关,MEGE MODE可以在小数与整数间切换。 3.点击Annotation upload > upload data for Boostrap value styles 4. 设置命令为: 5.显示  以上设置将隐藏小于75的bootstrap值,不同范围的值取不同颜...

文章 win10/win7系统下无法重命名和打开文件提示文件名太长怎么解决

...p)+"\t"+newfilename) 更多可学习python课程:python语言入门精通

文章 Perl 入门 之 context 标量上下文与列表上下文

...数的列表,并且一个接一个地打印它们,这就意味着我们可以直接用它来打印array: my @array = ("Alpha", "Beta", "Goo");my $scalar = "-X-";print @array;              # "AlphaBetaGoo";print $scalar, @array, 98; # "-X-AlphaBetaGoo98"; 强制标量上下文获...

文章 IF=8.5|一千多个酵母基因组分析揭示基因家族进化的独特轨迹

...。进化速度越快的谱系丢失的基因越多,物种形成的速度越快,这凸显了基因家族收缩的作用。 01 — 文章内容 1. 基因家族多样性与真核生物的总基因含量相关 借助OrthoFinder工具分别分析四个群体(1154个酵母基因组、761...

文章 Linux三剑客之grep-文件中的信息捕获

...在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行,并将其打印出来。今天,我们结合以下示例,深入了解一下grep命令的详细使用方法。 grep是什么 grep命令,全称为Global Regular Expression ...

文章 多分组venn图绘制脚本

...的数据是6组,一列一组,,列名为组名,修改成这样就可以直接用

文章 第9期武汉站“基因家族分析实操培训班”开始报名了!

...参加的同学,赶紧扫描下面的二维码进行报名吧!有问题可以微信联系llcheng1314 优惠信息: 1. 最早确认报名的15名学员赠送价值499元2019年版《基因家族分析》视频课程;已购买过该课程的前15名报名人员,则按实际购买价...

文章 kraken2生成的biom文件处理

...成的biom文件中taxonomy并不是最终结果,比如下面这样 可以用脚本来处理,删除未具体命名的分类级别 import argparse from biom import load_table, Table import numpy as np def main(): # Parse command-line arguments parser = argparse.ArgumentParser() p...

文章 绘制展示基因在样本中表达量与数量的柱状图

...725920.283840.2718330.3164450.7429480.744104 -l 指定图例的位置,可以设置成none,left,right,bottom,top,or two-element numeric vector 使用举例: Rscript lnc_exp.r -i All_lnc_gene_fpkm.tsv -l top -p lnc_exp_Histogram 结果展示:

文章 nomogram_multi_cox.r 多因素cox分析构建模型并绘制列线图nomogram

...表达量多因素cox分析https://www.omicsclass.com/article/1533 ,但这个脚本支持输入临床数据用于模型构建并绘制列线图,列线图用的R包rms; $Rscript $scriptdir/nomogram_multi_cox.r -husage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/nomogram_multi_cox.r       [...

问题 各位老师好,在做mcscanx共线性分析的时候,提取pep.fa的时候,pep.fa应该是输出文件,结果报错Could not read file 'pep.fa': No such file or directory

脚本内容如下 报错信息如下 如果创建了pep.fa的空白文件的话程序可以正常运行,但是文件没有输出结果。 希望各位老师能够答疑,小弟感激不尽!

文章 silva做菌种鉴定

... 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂...