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文章 如何处理矫正GEO数据批次效应(batch effect)

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

文章 饼图pie-ggplot2

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文章 抗独特型抗体制备常见问题解析

...目标抗体药不结合的风险。   八、双抗的抗独特型抗体怎么制备? 针对双抗,抗独特型多抗可以通过直接免疫并纯化获得。抗独特型单抗则需要针对两个不同的靶点进行竞争筛选方法,从而获得分别识别不同靶标表位的竞争...

文章 PASA 记录

PASA是我们进行基因结构预测的时候常用的软件,其最早是开发用于拟南芥的基因结构注释,目前在动植物的注释中被广泛应用。 一、PASA使用准备文件: 1. genome.softmasked.fa # 软掩码之后的基因组2. all_transcripts.fasta  # 有参、无...

文章 perl中的正则表达式

...操作符的扩展,使用新的字符串替换指定的字符串。基本格式如下: s/PATTERN/REPLACEMENT/; PATTERN 为匹配模式,REPLACEMENT为替换的字符串。 例如我们将以下字符串的"google" 替换为"runoob": 实例 #!/usr/bin/perl $string = "welcome to google si...

文章 R语言基础入门—数组

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文章 分组柱状图添加误差线(位置)--ggplot2

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文章 当潜规则遇见科技服务,都是套路

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文章 TCGA临床数据下载—TCGAbiolinks

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文章 密度图--ggplot2

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文章 R语言基础入门—运算符!

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文章 GEO数据库之芯片数据下载

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问题 ANNOVAR变异注释报错:Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

...老师们能不能出一期视频讲一下如何解决这个问题,以及怎么手动修改错误的数据

文章 群落分析的冗余分析(RDA)概述

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文章 影响GWAS关联分析好坏的因素

...定位效应很小或者频率很低的基因,我们可以用GWASpower/QT软件辅助群体大小的选择,通过输入遗传力、标记个数等参数,可以计算达到预期检测功效需要的群体大小。根据经验,一般情况下推荐群体大于300个,另外可以通过选择...