问题 做转录组分析建立索引时，出现如图的问题，看资料是mRNA和cDNA名称一样，问老师，老师发了一个连接，里面有一个 AWK命令，老师建议修改一下，自己按照理解，修改了一下，但一直未达到目标，想问一下老师，怎么修改！

问题 求教老师，我在做大麦基因家族分析构建进化树时，拟南芥中的已知的成员和我大麦中鉴定出的成员分不到一起，拟南芥单独分了一支，没办法做比较，这种情况怎么解决呀

因为这个家族只在拟南芥里鉴定过，只有18个成员，我做的亚族只有4个成员。现在拟南芥和大麦构建进化树的结果没法做比较

问题 请问为什么三个pca成分成为作为pca协变量控制群体结构对GWAS关联准确性的影响进行GLM和LLM时，识别到四个协变量，删除第一行截距后，仍旧识别到四个协变量，这是为什么啊

 /data/soft/gemma/gemma-0.98.5-linux-static-AMD64 -bfile /wtmp2/user049/yushiyan/prune_/alleledphwemafmissing_LDfiltered.snps -p /wtmp2/user049/yushiyan/phenotype/pheno.txt -c /wtmp2/user049/yushiyan/pca/cpca_no1.txt -lm 1 -n 1 GEMMA 0.98.5 (2021-08-25) by Xiang Zhou, Pjotr Prins and team (C) 2012...

文章 VirtualBox虚拟机网络设置（四种方式）

...解：Vhost访问网络的所有数据都是由主机提供的，vhost并不真实存在于网络中，主机与网络中的任何机器都不能查看和访问到Vhost的存在。 虚拟机与主机关系： 只能单向访问，虚拟机可以通过网络访问到主机，主机无法通过网...

问题 老师，你好。在做有参转录组分析，转录本基因表达量出来之后，发现里面找不到我期待的同源基因（ID)，不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID，问题是这些ID在我的注释文件里根本没有，详细情况如下

命令如上，产生其中一个（T01)结果如下：找不到我所期待的基因，这是什么原因呀

问题 测序数据质控报告GC分布

...盖度，但是除了物种本身的十几条染色体外，最后出现了5.8S核糖体RNA和U1剪切RNA（pseado），这是为啥呢？是因为测序建库的DNA中有RNA污染吗？谢谢

文章 Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具

...间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传关系以及基因流事件，帮助我们理解物种的进化历程和群体的历史动态。今天，就让我们一起来深入了解一下这款软件。 Treemix 原理 Treemix的基本原理...

文章 R包 CandiHap 进行单倍型分析

CandiHap是一款应用于全基因组关联分析（GWAS）后，快速分析基因单倍型来鉴定候选基因的一款友好软件。研究者可通过该软件对单个基因，或者对GWAS显著关联位点LD范围内所有基因进行单倍型分析，发现与性状显著关联的单倍型...

问题 老师，您好，学习咱们得基因家族分析课程。按照咱们得代码运行，发现第二次搜索hmmsearch，发现输出空吧，我把以前生成的文件和你们提供的demo比了一下都一样，可是WRKY_domain_new_out.txt空白

问题 老师您好，我本来打算做BSA，因为担心BSA定位区间过多，所以对F2群体中极端个体各40株进行了单株测序，现在打算拿这个数据做一下BSA相关分析，请问如何利用单株测序数据模拟混池测序数据呢，麻烦您了

问题 老师好，筛选出58个基因，与拟南芥共建进化树，进化树里面除拟南芥外基因有58个，基因结构分析也是58个，但是meme网站的xml文件用tbtools做图后就变成了56个，请问是什么原因呢

文章 Docker Volume - 目录挂载以及文件共享

...将会从读写层下面的只读层复制到读写层，该文件的只读版本仍然存在，只是已经被读写层中该文件的副本所隐藏。当删除Docker容器，并通过该镜像重新启动时，之前的更改将会丢失。在Docker中，只读层及在顶部的读写层的组合...

问题 关于泛基因组的pangene.list

...述（比如我想知道他这个的具体作用是什么），目前我在分析的物种（https://edmond.mpg.de/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.17617/3.AEOJBL）中未找到该List，向原作者要数据会有些困难，请问这个List是否重要的事泛基因编号，我是否可以通过...

文章 IF=13.8 | 柬埔寨活禽市场环境监测与传统监测在病毒检测效能上的对比研究

...irculating viruses from live poultry markets in Cambodia ”的宏基因组分析文章。” 01 — 研究背景 鉴于亚洲活禽市场在公共卫生安全中的特殊地位，传统的家禽个体采样监测（如口咽和泄殖腔拭子）虽然是目前的主流手段，但其存在成...

文章 论文作者署名：导师和学生之间的一场大战

... 第二件是： 复旦大学某教授，为了给学生争取署名权而不惜从某核心期刊撤稿，引来一片“怒赞”。 这两个新闻，真的是给了学霸姐姐巨大的冲击， 学霸姐姐也不能妄断这两篇新闻里面孰是孰非， 但是论文署名真个问题，...