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问题 NBS基因家族进化树构建的时候,为什么有些同类(具有相同的结构域)如具有RPW8结构域的基因不是都聚在附近的一个分支上?

...的基因中,哪怕是建立特异模型后。请问这是什么原因。怎么才能将这些同类的基因聚到一起

问题 Launch_PASA_pipeline.pl脚本报错连不上mysql?

...老师我在运行pasa组装转录本的时候遇到如下报错,应该怎么解决?我的mysql数据库是配置好的 -connecting to MySQL db: Specie_name_pasa -*** Running PASA pipeine: * [Wed May 15 16:19:38 2024] Running CMD: /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/scripts...

文章 Python 操作 读取 写出 Excel 文件 提高工作效率

...thon 的一大应用场景,而 Excel 又是当前最流行的数据处理软件。因此用 Python 进行数据处理时,很容易会和 Excel 打起交道。得益于前人的辛勤劳作,Python 处理 Excel 已有很多现成的轮子,比如 xlrd & xlwt & xlutils 、 XlsxWriter 、...

文章 R包venn绘制韦恩图

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

文章 记录一个用AI排除错误banksy

... files, listed 1 directory (ctrl+o to expand) ● 输出文件是二进制格式,让我用其他方式读取。 Read 4 files (ctrl+o to expand) ● 找到两个错误,核心问题在第一个。让我查 BankSy 源码确认根因。 Searched for 7 patterns, read 2 files, listed 1 directo...

文章 R语言sort()与order()

...习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信...

文章 NCBI高通量测序数据SRA数据库下载新方法

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文章 graphpad prism绘图时,Y轴的缺口设置

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问题 转录组上游分析之定量比对Hisat2出现内部异常错误

...数据库得知为双端测序,但是一直是这样的错误,不知道怎么回事 另外,我用了fastp进行数据过滤,也得到同样的bug,所以不是数据过滤的问题同时我把-1和-2的$变量目录改成绝对目录,也是不行,还是同样bug难道是索引问题?...

文章 R语言绘制多分组差异分析结果图

...a<-read.table("Volcano1.txt", header=TRUE,sep = "\t") head(data) 文件格式如下: ID    FDR    log2FC    clusterOs01g0140500    1.281171e-04    -1.028091    CK_vs_KO1Os01g0141700    9.160378e-11    1.914777    CK_vs_KO1Os01g0339500    4.491034e-07 ...

问题 老师,我在学习基因家族视频,用perl脚本get_gene_weizhi预测基因顺式作用元件时出现了问题,老师请看

...查看Ggene_weizhi.fa,跟上面一样的结果 老师,我这个是怎么回事儿呀,我又是初入这个领域,才学疏浅,望老师指导!

文章 从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK

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文章 快速高效KM生存曲线绘制-脚本使用

...同变量分别对患者生存的影响。 作者根据基因表达量和细胞浸润程度的高低对样本进行分组,以总生存期(OS)绘制KM生存曲线,随着时间的推移,生存率从1逐渐下降,但可以看出黄色生存曲线始终高于蓝色生存曲线,即说明...

文章 rgb函数选择颜色(并控制深浅)

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文章 R 检测是否有-Inf/Inf NA NaN

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