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问题 泛基因集执行命令时，由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗？我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因，是什么原因？这正常吗

...t\\tEnd" > final.last.gene.pair.txt执行上述命令时，syn.txt文件中还含有Ensve08_g003360基因的存在，为什么到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时就不存在了？而且除了该基因外，还有一些基因是丢失的，是什么原因？这正常吗

文章 melt函数对数据进行整合

...整合，比较常见的就是利用ggplot2包进行图片绘制的过程中往往需要对数据进行整合，melt()的使用方法如下：加载R包以及案例数据 library('reshape2') dat  type  sample1  sample2  sample1  sample21    A 6.332968 5.367671 5.171107 5.5337542...

文章 单细胞转录组测序简介

...ops是基于微流控产生的油包水的方法来隔离细胞，并且是用带barcode序列的引物微珠来标识细胞的，是高通量的方法；Seq-Well采用微孔芯片来隔离细胞，再用微珠来标识细胞，属于高通量方法。 10x Chromium原理 目前应用最多...

文章 多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

...对话框： 4.1  编辑字号大小,显示长度 选择configure 中的project选项卡,进行显示样式设置: 4.2  编辑不同相似氨基酸颜色: 选择configure 中的shade选项卡,进行彩色设置: 怎么样？这样看起来就漂亮多了吧！自己赶快来试试...

文章 推荐100个接收基因家族分析/泛基因家族分析文章的期刊，速领！

...Excel包含信息如下：期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科... 总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊，闲暇之余，小编就整理了一下接收过基因家族分析类文章的期刊，供您投稿时参考！此Excel包含信息如下：期刊...

文章 如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

在R中如何利用ENSEMBL ID获得Gene ID(ENTREZID), 又或者转换为Gene Symbol，以人为例： 预先安装AnnotationDbi 和 org.Hs.eg.db 加载org.Hs.eg.db > library(org.Hs.eg.db) 获取所有的ENSEMBL ID，并查看前五个ID > k=keys(org.Hs.eg.db,keytype = "ENSEMBL")> head(k...

文章 2019年国自然基金热点方向——CRISPR/Cas9技术

...末，学霸姐姐就已经小小的预测过2019国自然新风向， 其中包括肠道菌群、外泌体、单细胞测序等大热的方向， 另外还有一个就是——CRISPR/Cas9技术，学霸姐姐一直是非常看好的， 4月29日，国自然基金的初审结果已经公布了，...

文章 组学大讲堂携手网易，所有线上课程折上折

...场的生存需要的是能力，没有过人的能力，就很难在职场中快速的成长。再者，目前大环境不好，许多公司的招聘力度都降低了不少，如果你想找一份合适的、称心的工作，那么就要提高自己。就生物类公司而言，做分析的薪资...

文章 堆叠柱状图-ggplot2

绘制堆叠柱状图，重点重点在于geom_bar中postion="stack"， 数据参考：https://www.omicsclass.com/article/92 dat   type  Sample Num1     A sample1  902     B sample1  343     C sample1  564     D sample1  995     E sample1  156    ...

文章 这本SCI期刊的录用率高达100%！！真相是......

...的因素太多太多了，所属学科、历年影响影子、H指数、中科院分区、审稿周期、出版周期、年发文量等等都得考虑，相信每一个科研汪都曾被这些指数所困扰，但是还有一个非常重要的指数必须要看，那就是——平均录用比例...

文章 序列分析软件-DNAman使用介绍（二）

...，可以设置元件类型颜色及命名，元件设置成功后鼠标选中还可以移动位置。 Text可以添加文字及设置文字格式；Sites可以添加酶切位点；Drawing可以绘制着重框，成品图见下方： 2. 序列展示 DNAman可以多形式展示序列信息,可...

文章 Pheatmap绘制多分组热图

...图格子的边框色display_numbers = TRUE：设定在每个热图格子中显示相应的数值，number_color：设置数值字体的颜色cellwidth和cellheight：设定每个热图格子的宽度和高度main：添加主标题fontsize_row 和fontsize_row：设置行名列名文字大小注意...

文章 手把手教你在线分析转录因子结合调控分析（植物）

...发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分...

文章 生物专业由冷转热？你还敢选生物专业吗？

20世纪末，中学校园里一直流传着这样的“预言”：“21世纪是生物的世纪”。 在这个“预言”的感召下，很多人毫不犹豫地选择了各大高校的生物专业， 当年大学的生物专业分数线硬是“高人一等”哦~ 而在以后的十几年...

文章 edger_analysis.r 差异基因分析edgeR

使用方法: $Rscript $scriptdir/edger_analysis.r -h usage: /work/my_stad_immu/scripts/edger_analysis.r [-h] -i filepath -m filepath -t treatname --control CONTROL --case ...