找到约 15 条结果

问题 重测序中SNP分析

... in seq.default(0, chorm.maxlen/bp, round(xticks[2])) :   invalid '(to - from)/by' Calls: CMplot -> DensityPlot -> seq -> seq.default Execution halted，我的参考基因组是scaffold，最长的是1267525bp,最短的是1900bp,共66条，请问这里该怎么解决呢？

问题 hmmsearch的选择

像这种 从一个开始 后面两个 from to 就不一致的应该如何选择呀?

文章 split_sample.r根据生存数据对样本随机分组

...p propotion, --propotion propotion input propotion of train set to test set,default:0.6 -o outdir, --outdir outdir output file directory [default cwd] -n name, --name name output file name prefix [default demo] 参数说明： -i    输入...

问题 GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题

具体问题提示为：java.lang.IllegalArgumentException: Sample Line68 has an inconsistent number of alleles. The first genotype is diploid, but the genotype at position Chr2:35902177 is haploid

问题 TBtools无法使用和更新

点确定和X都关闭了，请问怎么解决？

问题 ggtern 运行报错

geom_point requires the following missing aesthetics: x and y

文章 python读取 Perl's Config::General module.

from apacheconfig import *options = {    'lowercasenames': False # If set to True, then all options found in the config will be converted to lowercase}with make_loader(**options) as loader:    config = loader.load(args.cfg)print(config) https://github.com/etingof/apacheconfig

问题 R下载GEO数据没有显示GSM1625995 = col_double()

你好，视频里用R下载GSE数据时,输入gset = getGEO(GSE, GSEMatrix = TRUE, AnnotGPL = TRUE,destdir = workdir)后有一段红字显示： Parsed with column specification:cols(     ID_REF = col_character()     GSM1625995 = col_double()     ....     ....）File stored at: F:/GEO...

文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

... Zhang X, Sun W, Hou X, Yao Z, Zhu Y. CRISPR/CAS9-Mediated Genome Editing of miRNA-155 Inhibits Proinflammatory Cytokine Production by RAW264.7 Cells. Biomed Res Int. 2015;2015:326042. doi:10.1155/2015/326042 Xu C, Lu Z, Luo Y, et al. Targeting of NLRP3 inflammasome with gene editing for the...

问题 电脑内存不能升级，运行Rstudio内存一直上升，请问还有其他方法解决这个问题吗。

...ype) :    Primary solid Tumor was not found. Please select a difinition from the table above  >                       sample_type<-"Primary Tumor" > # 查询需要下载的甲基化数据（本次分析只下载肿瘤样本） > query.met <- GDCquery(project = tcga_...

文章 单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

...oord_flip()+  theme_bw()+  theme(panel.grid = element_blank(),     axis.text.x=element_text(hjust = 1,vjust=1,angle = 45))+  labs(x=NULL,y=NULL)+guides(size=guide_legend(order=3))+  scale_color_gradientn(values = seq(0,1,0.2),colours = rev( brewer.pal(11,"RdYlBu"))) #改变一下颜色 ...

文章 遗传图谱中各种作图群体介绍

... Mangino, G.; Pascual, L.; Díez, M.J.; Prohens, J.; Gramazio, P. The Dawn of the Age of Multi-Parent MAGIC Populations in Plant Breeding: Novel Powerful Next-Generation Resources for Genetic Analysis and Selection of Recombinant Elite Material. Biology 2020, 9, 229. https://doi.org/10.3390/biology9...

文章 maf_oncoplot.r突变注释文件分类可视化maftools

...,default: NULL] -T topgene, --top topgene Number of top genes displayed [optional, default: 20] -l genelist [genelist ...], --genelist genelist [genelist ...] the selected gene list to display [optional, default: NULL] -t,...

文章 快速高效KM生存曲线绘制-脚本使用

...造成的影响。 例如：2021年发表在The Journal for ImmunoTherapy of Cancer上的一篇影响因子为13.75的文献为例，该文献中运用KM生存曲线生动形象地展现了不同变量分别对患者生存的影响。 作者根据基因表达量和细胞浸润程度的高低对样...

文章 NCBI批量下载数据,省时又省力

...也能帮到大家！ NCBI批量搜索、下载序列 脚本代码： from Bio import Entrezimport os,sysfrom Bio.Seq import Seqfrom Bio.SeqRecord import SeqRecordfrom Bio.SeqFeature import SeqFeature, FeatureLocationfrom Bio import SeqIOimport sys, os, argparse, os.path,re,math,time'''database:[...