今年的618购物节已经开始嗨了，不少想换笔记本的同学来咨询我们：做生信分析，买哪款笔记本好呢？ 其实早在去年我就写了一篇文章，系统的讲解了下做生信分析用的笔记本的选购原则（点此观看），今年就来点更直接的...
...然后我把这些基因名称拿到gff3中查找，发现基因的位置信息基本是一样的，如下两行是两个名称不同但序列相同的基因的注释信息： 4 ena mRNA 4388266243889224 .-.ID=transcript:PNT65252;Parent=gene:BRADI_4g39317v3;biotype=protein_coding;transcript_...
... Data Portal。 然后点击DCC Data Releases，查看数据更新版本信息。 点击跳转页面后，我们可以看到不同时间更新的数据版本信息，一般选择最新版本的数据来进行分析。点击current，就可查看最新版本的数据。 点击Projects就可进...
...logFC，实际表示log2FC，为差异变化倍数，第三列为上下调信息，基于第一列和第二列的信息的阈值进行筛选获得，需要给这一列信息进行设置，设置为有序因子，方便后续图片颜色设置temp1$Regulate=factor(temp1$Regulate, levels=c("Up","Down...
...因组中的数目、长度和占比的时候，是只需要SINE 那行的信息还是需要统计SINE 那行及下面四行的信息总和（比如数目的话就是 757+333+380+259+267）
...- c("110", "101", "abc", "cabs")> which.max(nchar(a))[1] 4 更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深...
...并撰写成文章？？ 其实这些问题都可以通过学习生物信息学，培养实验室数据分析师来解决！ 学习生物信息学，能够自主分析测序数据，让您节省一半的总体费用，同时远低于公司的个性化分析时间，大大加快您的成果转化...
我第一次注释重复序列时没有给DNA-MITE进行分类，但是最终的统计信息里MITE类的转座子占了20%，然后我重新使用DeepTE对MITE转座子进行了分类，请问老师能否不重新跑RepeatMasker得到contig.fa.tbl的重复序列信息统计文件
...1.如果这3个GSE系列是在同一平台，都是单通道芯片，样本信息显示如下图，那么数据信息是不是现成的已经经过标准化的数据？2.2.如果这3个GSE系列不在同一GPL，可以在GEO2R后可以直接求交集吗？3.单个GSE***中都有实验组和对照组...
...得到，然而单个个体是无法代表整个物种的全部遗传变异信息的。因此，泛基因组将成为高质量参考基因组的新标准。委托公司进行泛基因组分析的价格不菲，为了满足大家能够自己进行分析的需要，组学大讲堂制作了《动植物...
... 文档管理: 发布文档文件 存储文件，集成SVN代码管理 7. 信息管理: 活动统计报表，项目报表的导入和导出功能，信息筛选，预警和邮件提示 8. 共享管理：团队新闻,Wiki和论坛等功能 CORNERSTONE项目管理工具，刚好就具备了这...
...族鉴定 根据Pfam当中WRKY基因家族的保守结构域（PF03106 ）信息利用HMMER 3.0在菠萝基因组当中对所有基因法人蛋白质序列进行搜索，找到具有该保守结构域的基因，如果存在保守结构域即为WRKY基因家族候选基因，再用PFAM and SMART两...
...三，仅次于JAVA和C语言；python的流行与他的 python与生物信息 python在生物信息数据分析科研领域发展也非常快，诞生了很多与生物信息数据分析相关的软件和功能包，例如：Biopython、Qiime、HTSeq、Pysam、ETE、RSeQC等等，所以，现...
...例如，下载某物种某染色体XXXX-XXXX碱基区域内的全部基因信息，尤其是BSA、QTL定位、GWAS等项目客户，该类需求是很多的；之前给大家分享过一个利用Ensembl数据库网站提供的biomart工具进行基因组特定区间基因及注释信息的提取，...