问题 GEO基因差异分析中，数据提取后，进行组间筛选差异基因时，进行上调下调后，为什么没有上调下调基因，都是normal呢？

问题 在做无参考基因组的基因家族分析时，我能否用hmm方法用pfam号筛选全长转录组的di19家族成员

问题 老师，从GEO数据库下载的数据是标准化后的RNA-seq数据，能用哪个R包进行差异分析

问题 老师，您好，转录组分析时，比对完reads，进行sam文件转换为bam文件，不报错，只出现killed,如图中情况，老师帮忙解答一下！

问题 老师您好，go/kegg分析一般用多少相关基因呢，筛出正相关基因有7000多可以做吗，对准确度会不会有影响

问题 老师您好！我想做的物种只能找到fna文件和gbff文件（已经确认只能找到这两个文件），请问这种情况下如何做基因家族分析？

问题 你好老师，我是首次接触家族基因分析，数据从ncbi下载，想要转换一下格式，使用你的脚本，出现这个情况，该怎么办呀？

问题 老师您好，基因家族鉴定的时候，要求使用 GA 阈值重新运行 hmmsearch 分析保守结构域。请问这个GA阈值是什么啊，应该怎么操作呢

文章 组学大讲堂周年庆特大优惠---VIP最高返礼6800元！！

组学研究中，数据看不懂、新人难上手、外包成本高，是不是让你头疼不已？别慌，组学大讲堂超级 VIP 来拯救你，助你一键破局！ 点此处直达VIP详情页：VIP详情页 点此处联系客服了解详情：客服 省钱小能手，性价比爆棚...

问题 启动子分析，使用get_promoter.pl提取上游序列时发生如下报错（不能读取脚本第21行），请问该怎么修正啊？

从云盘直接下载下来，没有修改，报错，请问应该如何修正？

文章 如何看懂微生物多样性分析当中三元相图ternary

微生物多样性分析当中，三元相图Ternary图可以展示物种在不同分组当中的相对丰度的大小： 三元相图当中，不同的点代表不同的属，当然也可以是其他的分类水平，点的大小代表了该属在不同分组当中平均丰度，点的颜色代表...

问题 treemix用例子，按照步骤操作，得出结果和老师的不同

...了一遍，并作出了图。 但是发现，我得出的结果和您的不同，热图和似然树都不一样，发生基因流的群体不一样，这是哪里出了问题，还是什么原因，是需要调整群体排序，还是需要设置外群吗？ 下面是我的结果和老师的结...

问题 我运行你在有道笔记中的GEO数据库分析遇到问题？

我发现 DEG_list_kegg是1487行，而map_ids是1468行。 这个是得出DEG_list_kegg的代码， degs一开始是1487行，去除没有entrezid的行后，为1468行 degs<-degs[!is.na(degs$entrezid),]   #去除没有entrezid的行    #将字符转换成数字，注意一个基因有...

问题 RNAseq有参转录组数据自主分析课程，在建立基因组索引的时候出现如下问题

网易云课堂《RNAseq有参转录组数据自主分析课程》第4课时，建立基因组索引，运行的命令，sh $scriptdir/index.sh Homo_sapiens.GRCh38.dna.chromosome.22.fa Homo_sapiens.GRCh38.99.chromosome.22.gff3，在服务器上运行，最后获取gene length时候出错： get gen...

问题 HGMD数据库

...个单基因遗传病的突变位点和表型关系的研究，这个基因不是什么热点基因，遗传病发病率也不高，所以就要求尽可能的掌握每个突变位点的详细信息如additional phenotype和functional evidence，我手里目前有近20个位点，①很多普通版H...