...A FAM83A IGLV3-9 STARD3 -o lasso 参数说明： -i 输入生存数据与基因表达文件 barcode TIME EVENT FGR CD38 ITGAL CX3CL1 CEACAM21 MATK CD79B MMP25 TCGA-B7-A5TK-01A-12R-A36D-31 288 0 16.34408 86.86772 40.26903 603.0132 1.868536 2.28342 ...
最近分析串联重复基因，按照视频中的做完，发现很多串联重复基因并不存在与同一条染色体上，请问它们属于串联重复基因吗？ 这是blast结果 这是序列长度文件 这是最后得出的筛选结果
grep是perl里面的一个列表筛选函数，功能还是不错的。 grep有2种表达方式: 1. grep BLOCK LIST 2. grep EXPR, LIST BLOCK表示一个code块,通常用{}表示;EXPR表示一个表达式,通常是正则表达式。LIST是要匹配的列表。 示例： 统计匹配...
...ana.TAIR10.41.gff3 -out gene_exon_info.gff”跑不出结果，之后手动筛选出来，却没有exon等，用GSDS也没有结构，请问这个是不是无法分析？谢谢！
BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载呢？ BSA数据在哪里下载...
ENA数据库：European Nucleotide Archive：隶属EBI (European Bioinformatics Institute)，功能等同SRA，并且对保存的数据做了注释，界面相对于SRA更友好，对于有数据需求的研究人员来说，ENA数据库最诱人的点应该是可以直接下载fastq (.gz)文件，...
...bus）则是归档和自由分发科研人员提交的高通量基因表达数据的公共仓库。目前，GEO存储了大约10亿单个基因表达的数据，来自于100多种生物，内容广泛涉及到各种生物学问题。这些大容量的数据可以使用用户友好的以Web为基础...
trait文件的准备，比如可以使用0、1的分类数据来分类发育时期，同时使用关注单个基因的表达量来作为数量数据吗？ 两种数据类型是否可以出现在同一trait文件中？
...ve Matrix factorization ）是一个用于从单细胞 RNA-Seq (scRNA-Seq) 数据推断基因表达程序的分析管道。它采用count矩阵(N 细胞 * G 基因) 作为输入，并生成一个 (K x G)基因表达程序 (GEPs)矩阵和一个(N x K) 在指定数据中每个细胞的每个程序的...
国际上著名的综合生物数据库有三个，分别为NCBI，ENA，DDBJ ，高通量测序的数据往往会提交到这些数据库，下面分别介绍一下： NCBI|Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ；NCBI是由美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnolog...
是我哪个包没安装吗？
...数还能美化图片，非常强大。 接下来，我们就以文章的数据库以及鉴定好的油菜、白菜、甘蓝、拟南芥的MYB基因为例，给大家具体展示如何绘图。 数据准备 1. 下载数据 绘制图片之前，我们需要下载数据，这里我们以文章中...
随着生物技术的迅速发展，我们迎来了基因数据时代的全新篇章。NCBI Sequence Read Archive（SRA）作为全球最大的基因组学数据库之一，承载着来自世界各地的海量测序数据，包括基因组、转录组和表观基因组等重要信息。然而，随...
问题如上，但是我的转录组只能找到表达数据文件，请问老师这样还可以做吗？
国家基因组科学数据中心（National Genomics Data Center，简称NGDC）于2019年6月经科技部、财政部通知公布，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）作为依托单位，联合中国科学院生物物理研究所和中国科学院上海...