...然而这在很多的进化树文件（如nwk文件）中并没有，那要怎么使用呢？ 其实很简单，进化树文件中的 node id 是不需要生成的，iTOL在导入nwk文件时会为每个节点分配一个Node id。例如我用的nwk文件如下： 生成进化树后，可以查看...
...结果是空的…… 前面都是按照课程的脚本跑的 请问该怎么处理这个报错呢？
在做基因家族分析时，感兴趣的蛋白含有2个以上保守结构域，对应的有多个pfm号。请问这种情况怎么处理？是分别用不同的pfm号去搜索蛋白然后再合并在一起进行分析吗？
...构域的命令，报错脚本里第四行这个单括号有问题，请问怎么改？ manager@bl8vbox[PPR] script/domain_xulie.pl PPR_hmm_out.txt Daucus_carota.ASM162521v1.pep.all.fa PPR_domain.fa 1.2e-28 script/domain_xulie.pl: 4: script/domain_xulie.pl: Syntax error: "(" unexpected
你好同学，我想请问一下后来你是怎么解决你之前遇到的过滤后snp都没有了的问题？我遇到了类似的问题。 Parameters as interpreted: --vcf ALL.snp.filter.vcf --recode-INFO-all --maf 0.05 ...
...族的，但是鉴定的时候有时候会出现A，B，C这种情况应该怎么办呢，因为出现了别的结构域C，看论坛您之前说这类情况可以直接忽略C，但忽略C后家族成员序列长度需要发生变化吗？
...结果文件（如下图）里没有对应的染色体编号，请问应该怎么修改呢，这是输入的基因组序列文件
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...
...式，二者的区别就在于是否考虑跳过的exon的长度。 软件安装 conda create -n my_rmats_env conda activate my_rmats_env conda install rmats-turbo rmats-turbo --version 软件使用 参数说明： python rmats.py -h usage: rmats.py [options] optional arguments: -h, ...
如题，我没有使用Allhic挂载染色体，而是用的3D-DNA和Juicerbox，所有没有产生genome.apg文件，请问老师怎么产生chain文件？课程里好像只有.apg转.assembly文件和.apg转.chain文件的脚本，没有.assembly转.apg或者.assembly转.chain文件的脚本
...D）。结果表明高温胁迫导致鳃、脑、肝组织及线粒体等细胞器损伤，恢复阶段损伤缓解；氧化应激是高温致大口黑鲈组织损伤的关键因素，且机体具备一定的损伤修复能力。 2. 转录组分析和4D-DIA 蛋白组联合分析 提取三时间...
...因并没有串联关系，请问一下这个是什么情况呢。具体要怎么解决。 断线就如同上述所示，蓝色圆圈圈出来的。 找到原因了，确实是两个基因挨的很近然后链接又回来了。但是我看了一下我的text文件和link文件都没有问题，但...
...g/10.1038/s41586-025-09303-5 八个不同的 CAF 亚簇：肌成纤维细胞（myCAFs）、炎症（iCAFs）、抗原呈递（apCAFs）、血管（vCAFs）、增殖性（prolCAFs）、神经（neuralCAFs）、氧化磷酸化（OXPHOS CAFs）和发育 CAF（devCAFs） Supplementary Table ...
...这种结果影响了后面作图分析，我不知道原因所在，以及怎么解决，敬请指教！
...制的图片。 Docker使用 1. 准备文件：样本的OTU表（biom格式）、作者写的脚本和FAPROTAX数据库。获取链接：http://www.loucalab.com/archive/FAPROTAX/lib/php/index.php?section=Download（1）下载 （2）解压后（中间两个文件） 2. 启动docker及下载...