问题 关于单倍型分析的问题

老师您好！ 不太明白这句话：A haplotype network of SD6. The haplotype network was constructed based on SNPs at the SD6 gene region using 3,000 rice genome data。这个snp是指vcf文件中0|1,0|0,这种数据吗？还是来自一条染色体某区段的snp位点的组合？ 我在ht...

文章 igraph 包安装错误

... * removing ‘/share/work/biosoft/R/R-v3.4.0/lib64/R/library/igraph’ The downloaded source packages are in         ‘/tmp/Rtmply12uv/downloaded_packages’ Updating HTML index of packages in '.Library' Making 'packages.html' ... done 错误解决,临时不让他加载这些模块...

问题 WGCNA中绘制性状与模块相关性图出现colorMatrix[, c] : incorrect number of dimensions

之前完全没问题，绘图时出现错误 数据内容如下： 性状数据内容： textMatrix矩阵内容： 实在是不知道到底哪个矩阵的维度不对了...

问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

...f2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports the requested API version

文章 awk基本参数解释

...操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}ARGIND==1{print $0, $1;}ARGIND==2{}' file1 file2 awk后面的命令部分是用引号括起来的，可以单引号，可以...

文章 R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memory.size()[1] 94.2> memory.limit()[1] 8081 3、ls() 查看当...

问题 老师，我在预测启动子顺式作用元件时，出现out of memory,是怎么回事，下面是我报错的截图

这是我报错的截图 这是输入文件的截图

文章 鲈鱼MAPK基因家族分析文献下载及解读

...文献下载：Identification of mapk gene family in Lateolabrax maculatus and their expression profiles in response to hypoxia and salinity challenges.pdf（点此题目下载原文） 基因家族分析发文章溜不溜？口说无凭，以文章为据！基因家族分析学习链接：基因...

问题 老师，请问在进行共线性分析时，出现ValueError: A total of 0 anchor was found. Aborted.是什么原因呀？

文章 R语言基础入门—数据框

...每个列应包含相同数量的数据项。 创建数据框 # Create the data frame.emp.data <- data.frame(   emp_id = c (1:5),    emp_name = c("Rick","Dan","Michelle","Ryan","Gary"),   salary = c(623.3,515.2,611.0,729.0,843.25),    start_date = as.Date(c("2012-01...

文章 pfam上不去 打开后搜索没有反应

...想搜索的话是不行的： Please note: this site relies heavily on the use of javascript. Without a javascript-enabled browser, this site will not function correctly. Please enable javascript and reload the page, or switch to a different browser. 我们看到网页上提示JavaScript有问...

文章 叶绿体基因做跨物种系统发育分析

... Zhang Z, He Z, Xu S, et al. Transcriptome analyses provide insights into the phylogeny and adaptive evolution of the mangrove fern genus Acrostichum[J]. Scientific reports, 2016, 6: 35634.

文章 性价比超高5个重测序发IF=6遗传进化文章

...区域高寒胁迫和强紫外线照射胁迫相关； Torsten Günther1,2, Christian Lampei1, Ivan Barilar1, and Karl J. Schmid1. Genomic and phenotypic differentiation of Arabidopsis thaliana along altitudinal gradients in the North Italian Alps.2016.Molecular Ecology.

问题 16S扩增子分析中聚类分析出现问题。

...   running command 'timedatectl' had status 1 Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  :   line 50 did not have 5 elements Calls: read.table -> scan Execution halted 附件中是我的feature_table_tax_L3.txt以及尝试过的解决方案。报错信...

文章 R 包 osqp安装报错

...akeLists.txt:   Found relative path while evaluating include directories of "osqpstatic":     "R_INCLUDE_DIRS-NOTFOUND" CMake Error in lin_sys/direct/CMakeLists.txt:   Found relative path while evaluating include directories of   "linsys_pardiso":     "R_INCLUDE_DIRS-NOTFOUND"...