...ch file or directory: /biosoft/KaKs_Calculator2.0/src/AXTConvertor，应该怎么处理？我用的是咱们网站上下载的虚拟电脑bio-linux-8.0.7.
...结构不同的比如这种，是不是要从正链调整到负链，这种怎么调整呢
... 02-1. 系统发育树构建 提取39个GT64的蛋白序列，利用MEGA软件和ML方法构建系统发育树，根据进化分支分为5个亚家族，Class1~Class5。 根据同一亚家族中的成员关系，文章得出四倍体陆地棉和四倍体海岛棉都起源于二倍体棉花。 ...
请问如何利用基因在不同组织的FPKM值做热图？指示颜色范围的值如何标示？看了一篇文章中的热图（如下），颜色范围在-2——2，请问这个是fold-change的值吧，请问是怎么计算的，因为是不同组织，如何得出的倍数值？
...个物种的蛋白序列建库blast，我想问的是我现在两个物种怎么做？要放到一做吗？还是分别blast后mcscan后，吧文件汇总到一起再绘图吗？
...adODS", "readxl", "yaml")) 输入文件准备 table2itol的输入文件格式很多，以最常用的表格为例，格式如下： 第一行是表头，标注每一列的数据内容，每一列为一组数据。第一列通常是进化树中的叶标签。（图中数据为示例数据examp...
老师，您好。我再用vcftools计算Fst和Pi时，设置的窗口步长是一致的，但是跑出来的结果有一些区域出现了跳过的情况，导致两个文件的窗口不一致，如图所示，pi值的范围直接从15w到了50我，怎么解决这一问题呢？
docker 创建的环境在退出终端后就找不见了，只有原来的base环境，这是怎么回事呢？
docker 创建的环境在退出终端后就找不见了，只有原来的base 环境这是怎么回事呢？
...ue值； 要知道怎么筛选先看看文件说明，以下是结构域格式输出说明，官方说明 http://eddylab.org/software/hmmer/Userguide.pdf 在我们《基因家族分析实操课程》里面也有详细说明。 结果文件说明，如下，重点关注的参数已经标黄，...
PSI-blast 搜索结果为0，只有空的txt文件，没有pssm文件，是怎么回事呢
...是文献里鉴定出来的是14个左右，想问一下筛选的cdd条件怎么确定呢？使用STKc_MAPK作为筛选条件只有3个，STKc_MAP作为筛选有7个，以STKc作为筛选有163个，我查阅了文献，他们的筛选方法是保证有STK，丝氨酸和组氨酸的这个基序在...
tgsgapcloser --thread 15 --min_nread 3 --min_match 2000 --scaff ../genome.final.fa --reads ../ont.fasta --output ONTReads --racon /share/work/biosoft/Racon/latest/build/bin/racon 占用了800个G的运行内存，内存不够，自动退出了，怎么设置参数控制内存吗
基因组重复序列分析的时候，在运行【汇总 不同软件生成的repeat库，并用RepeatMasker进行重复序列注释】时候 for lib in ModelerAll.lib MITE_LTR.lib Homology.db; do blastx -query ${lib} -db ${SPROT} -evalue 1e-10 -num_descriptions 10 -num_threads ${threads} -out $...
...5的Bonferroni校正，p值达到10的-13次方。请问这么小的p值是怎么算出来的？应该采用哪种阈值呢？