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问题 老师你们好，想问一下如何在自己服务器上下载docker

现在一直在跟随组学大讲堂学习家族文章和BSA，但是都需要docker，看docker安装的课程，也没看到在服务器上具体安装，例如BSA中，mutplot这是一个软件吗？还是脚本？

问题 如何进行go和kegg的注释和富集

...如 tbtools需要输入 的 gene id和GI号 的文件 再比如 视频中讲到的，我研究的茶叶不在19种物种之列，该怎么办？ 还有是不是在线blastp无法进行批量swissprot注释？ 啰嗦这么多，就想，如何解决怎么从基因序列，找到go号。...

问题 python统计fasta格式的序列文件信息，包括长度，碱基数量等

我用python统计一个fasta文件中的序列基本信息，运行完后没有任何反应，在相应目录下也找不到任何文件，请问这个是哪里出错了还是怎么回事，运行后没有提示任何报错信息，没有任何结果

文章 运行Linux版本ProteoWizard中的chainsaw工具时报错

...ocale::facet::_S_create_c_locale name not valid 解决： 在当前环境中运行命令 export LC_ALL=C; unset LANGUAGE 之后再操作chainsaw工具，屏幕输出： Reading database: test.fasta Finished reading database. Digesting 1 proteins... Digestion finished. Time elapsed: 00:00:00.001...

问题 HGMD数据库

老师您好，我在一个帖子中看到您提供了一个HGMD数据库下载的百度网盘链接，可能是时间太久了链接已经失效。 我的需求是这样的，我正在进行一个单基因遗传病的突变位点和表型关系的研究，这个基因不是什么热点基因，遗...

问题 重复文章代码出错

...3&scene=21#wechat_redirect 在“人工智能（AI）在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测 ”一文中，运行到第10步（如上图）出错，提示：Error in rfImpute.default(m, y, ...) : No NAs found in m    请问，该如何解决，谢谢！

文章 小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

...学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常常见的一种图片了，此前小编教过大家如何用Excel来画热图（戳这里了解一下啊），但是它有一定的局限性：不能实现聚类分析。今天小编来教大家用一款简单不用安...

文章 Linux shell字符串截取

...结束。 截取结果是  123.htm 注：（左边的第一个字符是用 0 表示，右边的第一个字符用 0-1 表示） 原文链接：https://blog.csdn.net/jined/article/details/124196546

文章 rocks mysql数据库多实例数据库配置

...httpdsystemctl start httpd.service 1.什么是多实例? 在linux系统中代表：多个进程+多个线程+多个预分配内存结构 一般用来测试环境中，测试主从，高可用等。 多实例配置方案：（多个数据库管理系统） 端口port分开 配置文...

问题 关于单倍型分析的问题

...the SD6 gene region using 3,000 rice genome data。这个snp是指vcf文件中0|1,0|0,这种数据吗？还是来自一条染色体某区段的snp位点的组合？https://www.nature.com/articles/s41588-022-01240-7 我在http://server.ncgr.ac.cn/RiceHap3/这个网站下载了genotype文件，打...

文章 搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

... 运行必须在Java 1.8版本运行正常，java 1.9会报错； §建议用我们这个版本的eclipse，里面安装了很多插件（perl，python，R，shell等）免去自己安装插件的麻烦，如果是技术牛人也可自行安装所有最新版本的java，eclipse，activeperl等，...

文章 代谢组数据上传NGDC！简单又快捷！

​国家基因组科学数据中心（National Genomics Data Center，简称NGDC）于2019年6月经科技部、财政部通知公布，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）作为依托单位，联合中国科学院生物物理研究所和中国科学院上海...

文章 pheatmap绘制热图详解

...行的分组信息，需要使用相应的行名称来匹配数据和注释中的行，注意之后颜色设置会考虑离散值还是连续值，格式要求为数据框annotation_col列的分组信息，需要使用相应的列名称来匹配数据和注释中的列，格式要求为数据框anno...

问题 合并不同样品表达定量结果all_gene_count.tsv文件出问题

合并后的all_gene_count.tsv没有表达数值，但是各个文件中都有表达量显示，没有弄明白，只好请教老师了。 上图是修改后的命令

文章 单细胞分析 质控 线粒体 红细胞 核糖体

...可能是因为细胞质RNA穿过细胞膜导致，或者在取样的过程中死亡细胞过多正常：心肌等耗能较多的地方，线粒体基因含量也可能会比较高 人：^MT- 小鼠：^mt- 检测是否存在血红蛋白污染 人：^HB[^PES] 小鼠：^Hb[^pes] 核糖体污...