10 关于单倍型分析的问题

老师您好!

不太明白这句话:A haplotype network of SD6. The haplotype network was constructed based on SNPs at the SD6 gene region using 3,000 rice genome data。这个snp是指vcf文件中0|1,0|0,这种数据吗?还是来自一条染色体某区段的snp位点的组合?

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我在http://server.ncgr.ac.cn/RiceHap3/这个网站下载了genotype文件,打开之后如下图片,但是每个个体只显示了一个碱基啊,并不是vcf文件。不知道咋理解
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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

haplotype单倍型是多个SNP组成的,

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请问一下这个是哪个课程里的呢

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  • Jia 提出于 2023-03-09 10:34

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