...功，点击Load data下面的Run GSEA，就会出现下图界面：我们用不同的数字标记一下。 1：选择上一步导入的表达数据 2：选择基因集（根据你的分析目的） 3：置换检验次数(最多1000次) 4：选择表达数据对应的表型 5：如果你的数...
...相同基因家族的进化树，在其他该家族已经研究过的物种中，有些基因对应多个蛋白序列，应该如何选取哪一个的蛋白序列代表该基因构建进化树？ 期待老师的回答。谢谢！
...c.info<-roc(testset$group, pred1[,1], #提取随机森林模型中对应的预测指标 plot=TRUE, legacy.axes=TRUE, percent=TRUE, xlab="False positive percentage", ylab="True postive percentage", col="#4daf4a", lwd=4, print.auc=TRUE)plot...
GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件，他的下载比较简单，但是今天在配置的时候出现了一点小问题 下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gztar zxvf gatk-4.6.2.0.tar.gzcd gatk-4.6.2.0 配置 ./gradlew bundle ...
...您的提交数据(subCRA027185)以下文件审核报错，原因为数据中重复的序列ID超出限制, 请核查数据情况，修改后重新上传数据，并登陆数据库点run编号后的修改在线更新数据md5。
我看您在组学大讲堂中回复的“他的plink命令是 /biosoft/miniconda/bin/plink，我试了一下在 /biosoft/miniconda 目录下下载了v1.9版本plink，使用 /biosoft/miniconda/plink 就能够运行了”，这个具体怎么运行呢？老师您可以教一下我吗？
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一种是直接利用 biomaRt 包构建，另一种是利用 ....
...//api.github.com/repos/icbi-lab/immunedeconv/tarball/HEAD' failed 可以用Rstudio安装包： 以管理员身份打开Rstudio： 然后在终端依次运行： 以下代码： #设置镜像，local({r <- getOption("repos") r["CRAN"] <- "https://mirrors.tuna.tsinghu...
...w.omicsclass.com/article/604，然后导出nwk格式的文件再到evolview中编辑。 2.7 进化树bootstrap值修改参考 可参考：https://www.omicsclass.com/article/625 最后来一个组合图，看看设置的效果，当然我只是教大家如何使用，美观度上还是不足...
...数据。除SRA数据库之外，GEO数据库也是目前文章投递过程中要求进行数据上传的数据库之一。 网上关于GEO数据库的上传教程良莠不齐，推荐使用下面的方法快速上传自己的数据到GEO。 第一步 向GEO提交联系信息 正常登录NCBI，...
在绘制过程中，发现只能显示染色体，但是内部的线性关系都无法显示，查找了染色体的命名等问题找不出错误出来，请老师帮忙解疑一下。
请问出现如上提示如何解决？会影响最后的图吗？我的基因家族间link文件中的基因未完全在最后的图中显示出来 是受到这个的影响吗
... 归根结底，这些花式操作都是为了能专心备考、一击即中！ 大家也真的是不容易啊， 而今年，在众多的备考操作中，出现了一种新的操作，那就是——直播备考! “主播怎么要走？接着学习啊!” 直播备考，很简单， 就...
...致全球范围内30%以上的耕地出现不同程度的酸化现象。其中，铝（Al），即使是相当微量的浓度，在酸性土壤中也会明显抑制植物根系的生长，造成农作物减产。 不过，有研究发现，也有一些耐Al性非常高的植物，茶树（Camelli...