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问题 请问mcscanX比对时,这种情况是运行结束了么?

用的这行命令nohup  blastall -i Ssu_Sm.fa -d Ssu_Sm.fa -e 1e-10  -p blastp  -b 5 -v 5 -m 8 -o Ssu_Sm.blast& 输出了Ssu_Sm.blast文件,但是nohup.out输出文件为0,jobs查看命令显示[1]  + running    nohup blastall -i Ssu_Sm.fa -d Ssu_Sm.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -...

问题 单细胞测序数据分析#相同细胞不同处理之间差异B细胞差异时报错

执行此代码:Rscript $scripts/seurat_FindMarkers.r --rds  $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \  -p FindMarkers.deg.B  --group.by   "stim"   --ident.1 "stim"  --ident.2 "ctrl"    --subset.ident "B" \  --test.use  DESeq2   --logfc.threshold 0.25  后报错:Error...

问题 请问一下用CoNet构建网络没有环境因子表格可以做吗?一般用MENA、CoNet以及SparCC构建网络至少需要多少平行??

我用CoNet构建的网络,一处理5-8平行,直接上传的biom格式以及直接下载的OTU表格去构建,设置好参数,没有添加环境因子,点击“go”,每次都出现error

问题 WGCNA分析,最多能划分几模块?若一直beta值未达到0.8,怎么办?

对于划分模块有没有最多或者最小的限制?

问题 请问老师2基因家族得ID怎么在一共线性绘图里面表示出来,就像这样得图。

图怎么做的。

文章 B/T细胞分类:

...B细胞 naive B (Bn cells)、记忆B细胞memory B (Bm)、增殖B细胞(proliferative B cells),生发中心B细胞germinal center B (Bgc)、循环B细胞(cycling B cells)和抗体分泌B细胞(antibody-secreting cells ASC) Bn cells:   IGHD/TCL1A Bm cells:  CD27/TNFRSF13B Bgc cells:  ...

问题 老师,请问我如何操作这4exl才能得到完整的像课程中的一VCF?直接复制粘贴exl到一txt?

ding的SV数据.xlsx 表9-12应该是需要的SV文件;如何将4exl变成vcf文件呢?

文章 胃癌预后signature数据挖掘-自噬基因

...834. doi:10.3389/fgene.2021.615834. 数据来源: TCGA数据库:375胃癌病人基因表达数据和临床数据,包括表型数据,生存数据,年龄,性别,肿瘤大小,TNM分期等。去除OS 时间少于30天的样本,最终339样本用于后续的分析。TCGA当中...

问题 请问老师gtf这几文件有什么区别?应该下载.chr.gtf.gz 还是.gtf.gz?

问题 老师,我想做转录测序然后进行一些分析实验,我想问一下我应该选哪转录组课程啊?

问题 老师,请问我在运行get_gene_position.pl一直出现这问题怎么办?

问题 Linux教学视频的第8视频,里面有CMD.txt文件,我也没有啊。不知道哪里下载。

问题 老师您好,我想问一下这2挂载图哪是对的呢,为什么会出现这情况呢

问题 样品有12条染色体,60样品重测序样品,最后形成的总的clean vcf 为什么只有1条染色体了呢?

样品有12条染色体,60样品重测序样品,最后形成的总的clean vcf 为什么只有1条染色体了呢?

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