用的这行命令nohup blastall -i Ssu_Sm.fa -d Ssu_Sm.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o Ssu_Sm.blast& 输出了Ssu_Sm.blast文件,但是nohup.out输出文件为0,jobs查看命令显示[1] + running nohup blastall -i Ssu_Sm.fa -d Ssu_Sm.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -...
执行此代码:Rscript $scripts/seurat_FindMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \ -p FindMarkers.deg.B --group.by "stim" --ident.1 "stim" --ident.2 "ctrl" --subset.ident "B" \ --test.use DESeq2 --logfc.threshold 0.25 后报错:Error...
我用CoNet构建的网络,一个处理5-8个平行,直接上传的biom格式以及直接下载的OTU表格去构建,设置好参数,没有添加环境因子,点击“go”,每次都出现error
对于划分模块有没有最多或者最小的限制?
这个图怎么做的。
...B细胞 naive B (Bn cells)、记忆B细胞memory B (Bm)、增殖B细胞(proliferative B cells),生发中心B细胞germinal center B (Bgc)、循环B细胞(cycling B cells)和抗体分泌B细胞(antibody-secreting cells ASC) Bn cells: IGHD/TCL1A Bm cells: CD27/TNFRSF13B Bgc cells: ...
ding的SV数据.xlsx 表9-12应该是需要的SV文件;如何将4个exl变成vcf文件呢?
...834. doi:10.3389/fgene.2021.615834. 数据来源: TCGA数据库:375个胃癌病人基因表达数据和临床数据,包括表型数据,生存数据,年龄,性别,肿瘤大小,TNM分期等。去除OS 时间少于30天的样本,最终339个样本用于后续的分析。TCGA当中...
样品有12条染色体,60个样品重测序样品,最后形成的总的clean vcf 为什么只有1条染色体了呢?
...发高分文章! 基因家族分析课程重大更新 为满足大家更好学习基因家族分析,组学大讲堂对《基因家族分析》课程进行了一次重大更新!更新内容如下:1. 分析环境采用全新的docker虚拟机docker是一种更好用的虚拟机工具,其...