...很差，读一篇JBC的文章要五、六个小时，还常常不理解其中一些关键词句的意思,心里压力极大。 很幸运，我在约翰霍普金斯大学（Johns Hopkins University）攻读博士学位时，1991年4月遇到了学兄和启蒙老师John Desjarlais。听了我的...
...。 输入文件有两个，一个是VCF文件，另外一个是VCF文件中样本的分类文件。 sample1 pop1 sample2 pop1 sample3 pop2 sample4 pop2 他的使用一般有两步，第一步是运行preview，确定每个群体向下投影的值。 easySFS.py -i file.vcf -p pop.txt --preview...
...们伟大祖国母亲七十岁生日，无论是网络上还是现实生活中都充满了过节的气氛！ 这不，腾讯为了迎接这个神圣而又伟大的日子，特意推出了一项给头像加国旗的服务！相信这两天大家都被这一条朋友圈刷屏了...... “请...
...功能（例如化学感受相关，脂肪代谢相关等）从基因总表中筛选出一个基因集，但想获取这些基因的全部信息（比如序列、注释、表达量）并不简单，因为这些信息会储存在不同的表格里，这时候我们就需要利用基因ID从各个表...
在基因家族分析的视频学习中，设置好所有步骤并成功安装Docker Desktop后，根据老师的教程输入命令进入虚拟机时一直报这个“New state of 'nil' is invalid”。尝试卸载Docker Desktop后重启电脑重新安装还是这样。这种情况应该怎么办呢...
...Abiolinks下载数据 下载数据分为三步,分别用到TCGAbiolinks包中三个函数： 1）查询数据 GDCquery() 2）下载数据 getResults() 3）保存整理数据 GDCprepare() 以上三步中重点介绍第一个GDCquery()使用方法，其参数最多12个，而且每个...
我从soft文件里头提取出Ensemble_ID和GENE symbol，但是现在出现多个Ensemble_ID，我在和ENTREZID对应的过程中，这些多个Ensemble_ID对应之后以NA返回，这个情况要怎么处理呢？
请教老师，mcscanX能否用于动物基因组内基因家族的共线性分析？我看教程中是用于植物
...传的界面不动了, 经过排查,发现 ~/.config/BaiduPCS-Go 目录中的 pcs_uploading.json这个文件异常的大,可能是因为上传错误的累积等原因导致他一直没有清空,我们只需要手动删除这个文件就可以, 然后重启上传 正常的大小应该只有这...
使用网易云课程《Perl语言高级编程》中老师的同款perl脚本做SSR查找及引物设计时出现的问题：unescaped left brace in regex is deprecated here(and will be fatal in Perl 5.30),passed through in regex;marked by <-- HERE in m/([ACGT]{2})\1{ <-- HERE 0.5}/ at ../prim...
然后就是在后续的操作中，会出现无geneID的提示是什么原因
病毒的类别很多，而且是寄生在宿主中，不容易发现。采用高通量的测序方法，可以鉴定一些生物是否被病毒侵染，鉴定一些新的病毒。 采用小RNA测序鉴定病毒的基本策略主要包括以下3步： 1. 测序数据与宿主基因组进行比对...
...ft/augustus/latest/config//species ：contig后面怎么有两个斜线？用cd命令，正常应该是/share/work/biosoft/augustus/latest/config/species 2、根据提示，查看了目录species的权限，发现是可读可写可执行属性（drwxrwxrwx 111 root root 2556 Aug 23 2022 species...
大家好， 我用lima去除pacbio的barcode的过程中出现这样的问题： barcode序列是这样的： 5’ – pATCTCTCTCTTTTCCTCCTCCTCCGTTGTTGTTGTTGAGAGAGAT – 3’ lima ../m54220_181204_080956.subreads.ccs.bam primers.fasta test.demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi 有谁能给...
...，越来越多的老师开始着眼于转录因子的研究，各类基金中涉及转录因子研究的比例也是逐年增加。因此，我们决定分享一些转录因子的研究方法供各位老师参考，有不到之处或不同观点可以随时沟通讨论。 1.什么是转录因子 ...