找到约 15 条结果

文章 Treemix 软件:群体基因交流分析的得力工具

在群体遗传学研究,我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型,能够有效地分析群体间的遗传关系以及基因流事件,帮...

问题 Conet样本量只有五个

...以怎么处理这种情况呢?需要再多加两个样本,新加样本的值等于(前面5个样本和/5)吗?这样可以吗?想采取平均值法多弄两个样本出来,请问这样可以吗?会对结果有什么样的影响呢?

问题 Conet样本量只有五个

...以怎么处理这种情况呢?需要再多加两个样本,新加样本的值等于(前面5个样本和/5)吗?这样可以吗?想采取平均值法多弄两个样本出来,请问这样可以吗?会对结果有什么样的影响呢?

问题 荧光定量验证转录组结果该怎么看?

...验证转录组的结果,分析荧光定量数据的时候发现转录组说明差异基因上下调情况基本一致,但我做差异显著性分析时,发现试验组和对照组的基因都没差异,这种情况转录组结果是准确的吗?

问题 单细胞测序进行拟时分析绘制细胞骨架图

在进行单细胞测序过程可不可以绘制细胞轨迹骨架图,此外,可不可以选择自己想要的细胞类群进行分析(不是root_cell)。

文章 rgb函数选择颜色(并控制深浅)

R语言绘图过程,常会使颜色值,有时无法直接控制图片颜色的透明度,可以基于rgb()获取颜色,控制颜色深浅。 例如显示一下 红色: barplot(1,1,col="red")  当col="red"  或者col="#FF0000" 都是红色 而 rgb(255,0,0,255,maxColorValue=255) ...

文章 外源插入位置查找好方法

...起的参考基因组”上得到Mapped Data; 接着在比对上的reads筛选“一半比对到被插入基因上,另一半比对到插入序列上的junction reads”,根据junction reads的比对信息确定插入位置和方向; 最后,对这些reads进行聚类确定插入位置...

问题 计算KaKs

...哪里操作错了,注:已经将KaKs_Calculator2.0文件从课程视频下载并存放到share3目录下,并解压。 manager@bl8vbox[gene_deplication] /home/manager/share3/KaKs_Calculator2.0/KaKs_Calculator2.0/bin/Linux/KaKs_Calculator -i id1.axt. -o id1_kaks.txt Error in opening file......

问题 进化树构建

...构域批量筛选,或是还有什么便捷的方法能够把这个物种基因家族的序列下载全的?请大侠赐教,不胜感激。

问题 玉米单个基因与性状的分析

...可以测定其基因序列和对应的数量性状,如何分析是基因的哪些SNP导致了性状的差异。要挖掘该基因的优良等位变异后续研究应该怎么做,请简述方法并附相应的文献(有文献标题或者链接即可)

问题 泛基因家族分析绘制kaks>1频率分布的热图

可不可以将kaks_greater_than_1_gene_rate.txt,比值为0.0的WRKY成员删除,然后绘制热图

文章 awk统计某列文本次数

统计下面文本,第一列文本出现的次数(第2列没什么意义) gene    1cds    2gene    3gene    4rna    5cds    6 awk命令如下: awk  '{sum[$1]++}END{for(i in sum) print i "\t" sum[i]}' example.txt 结果如下: cds     2rna     1gene    3

问题 解压基因组文件和gff3遇到问题

老师 您好 我在Bio-Linux解压谷子基因组文件和gff3文件时遇到了以下问题,都显示 unexpected end of file

问题 关于KAKS的方法选择以及密码子选择

老师你好  在使KaKs_Calculator计算Ka/Ks的时候,我们应该怎么选择方法以及密码子类型呢,另外结果KS出现了NA的情况可以视为0么,多谢老师的回答

问题 染色体出现chr00是什么情况

gff文件染色体编号从chr00到chr12,但物种的染色体只有12条,在做基因家族染色体定位的时候在chr00上也有基因定位,出来的结果就有13条染色体,请问是怎么回事?