问题 请问老师我在MAFFT上构建进化树，结果是This is a Neighbour-joining tree without distance corrections。

这样有影响吗？并且树枝上没有数字。       MEGA软件一直报错。

文章 clusterProfiler模式物种的GO与KEGG功能富集与注释

...itleIndexorg.Hs.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Human3org.Mm.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Mouse5org.Rn.eg.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotation for Rat19org.Sc.sgd.dbBioconductor Package MaintainerGenome wide annotati...

文章 ggforestplot error: Error in assertAndRetrieveTidyValue(x, mean) : argument "x" is missing, with no default

...ration" ) #> Error in assertAndRetrieveTidyValue(x, mean): argument "x" is missing, with no default 解决办法是取消加载forestplot包，清洁环境并重新运行代码

文章 2020年读研还有用吗？工作 or 读研，到底选啥？

...报名， 在这个可以说是人生方向抉择的关键时刻，就业or读研，你真的想好了吗? 与此同时，学霸姐姐还看到了一些和考研息息相关的新闻事件，比如： ——69名准研究生爽约湖南大学 “录而不读”，被取消入学资格； —...

问题 R语言GAPIT跑GWAS错误 Error in ‘[.data.frame‘(GD,,!is.na(GI.MP[,3])):选择了未定义的列

问题 基因家族分析Ka/Ks时，在把aln文件转换成axt文件时，运行Linux命令遇到no such file or directory该怎么解决

文章 flowCore R包安装报错

...share/work/biosoft/R/R-v4.2.0/lib64/R/library/cytolib/include/cytolib/transformation.hpp:17,                  from /share/work/biosoft/R/R-v4.2.0/lib64/R/library/cytolib/include/cytolib/compensation.hpp:15,                  from pairVectorRcppWrap.h:10,                 ...

问题 不同物种共线性分析时，出现以下报错信息怎么解决呢？no such file or directory /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python

问题 看您的基因家族分析课程，aln文件转成axt文件，利用kaks转换时老出现如下no such file or ...，请问该怎么解决呢？

问题 微生物多样性分析课程镜像ampliseq-q2运行出错：there is no package called ‘BiocManager’

...成特征表，输入命令（省略了部分选项）： qiime dada2 denoise-paired         --i-demultiplexed-seqs    $workdir/1.import_data/demux.qza   --p-n-threads 2   --p-trim-left-f 29 --p-trim-left-r 18 提示： Plugin error from dada2: An error was encountered while runni...

文章 contig or scaffold GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

...contig.gff  或者 scaffold.gff  to  chromosome gff python3  -m jcvi.formats.chain fromagp genome.final.agp contig.fa  genome.fa 得到：genome.final.chain  再用 liftover转换：http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/liftOver liftOver -gff contig.gff3 genome.final.ch...

文章 PubMed文献按影响因子排序

...响因子大于30的杂志用完。如下所示： "CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS"[journal] or "NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE"[journal] 添加完影响因子大于30的之后，再重复上述4步把其他影响因子范围的杂志分别建立到不同的filter当中，这样自定义的...

问题 老师，做all_sample_qc时候python: can't open file '/qc_stat.py': [Errno 2] No such file or directory

[root@73d64505fa22  22:26:35 /work/my_rnaseq/2.data_qc]# python $scriptdir/qc_stat.py -d $workdir/2.data_qc/ -o $workdir/2.data_qc/ -p all_sample_qc python: can't open file '/qc_stat.py': [Errno 2] No such file or directory

问题 用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”

...接位点位置信息和外显子位置信息，之后用如下命令： hisat2-build -p 12 --exon ${EXON} --ss ${SPLICE} ${FASTA_File} ${BASE_NAME} 结果如图所示： 最后系统自动kill掉了建索引的进程，请问这该怎么解决？谢谢！

问题 老师您好！用meme分析motif时显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

...00 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100命令后显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢