问题 基因家族分析时，顺式作用元件提取只能提取列表中的一部分基因，请问是什么原因

请问老师，这是什么原因？

问题 基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件

用hmmsearch计算出的id，在进行基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件，在对gff3做出修改后输出的结果也不对，想请教老师是哪里出了问题，是脚本不对吗？又如何修改呢 输入文件 以下是过程这个是脚本 ...

问题 TCGA数据库下载数量不对

...一：按课上老师教的筛选方法，网页上cases和file数量为何不一致（456和521），老师课上是一致的。 问题二：按老师的代码，样本总量不等于肿瘤+正常总和，为什么呢？ query <- GDCquery(project = "TCGA-COAD",data.category = "Transcript...

问题 网易云课堂WGCNA-加权基因共表达网络分析问题

学习过程中报错，用老师的代码和数据，前面出图和老师的一样，卡在这步 sft = pickSoftThreshold(datExpr0, powerVector = powers, verbose = 5) pickSoftThreshold: will use block size 2938.  pickSoftThreshold: calculating connectivity for given powers...    ..working o...

问题 KEGG和GO富集分析报错问题

P和Q值设置为1，依旧提示报错：Failed to create bus connection: No such file or directory --> No gene can be mapped.... --> Expected input gene ID: LOC105382119,LOC105392385,LOC105383189,LOC105384039,LOC105384627,LOC105384151 --> return NULL... Error in barplot.default(kegg, ...

问题 老师，在泛基因家族分析结构变异的基因注释中，提取vcf文件有用信息列，$14是哪个

老师，在泛基因家族分析结构变异的基因注释中，#使用ANNOVAR对结构变异进行注释awk -F"\t|;" '{if($0!~/^#/)print $1"\t"$2"\t"$14"\t"0"\t"0"\t"$5"\t"$9}' all_merge.vcf > all_merge.input该指令中，第三列的终止位置是怎么得到的，在老师的all_merge.vcf...

文章 nfs的一个缺陷

...NFS方式共享出的目录，若后者宕机，那么前者的NFS分区即不可访问，使用umount不能够去除，df命令工作也不正常，等等。当然也可以重启消除此问题，可有几十台都要如此，那就惨了！ 这个问题是nfs的一个缺陷，很难解决。我...

问题 可不可以用转录组重测序的原始数据来分析其中microRNA等ncRNA的变化差异？

问题 老师，我做的是（某）人长链非编码RNA（lncRNA)的基因家族分析，如何获取其保守序列

问题 Erro基因家族分析报错：TC bit thresholds unavailable on model domain；如何解决

问题 老师您好！请问一下可以把拟南芥的基因和目标候选基因合起来做进化树分析吗？

问题 老师，请问一下做转录组数据分析处理，需要什么样的电脑配置呢（笔记本电脑呢）

问题 怎么利用公开的转录组做基因家族的表达分析，还有GEO和SRA的区别是什么？

问题 老师您好！请问对不同物种的同一家族蛋白基因序列进行多序列比较分析的研究思路是什么呢？

问题 计算每一个单因素cox分析，lapply函数，好久都没有反应，怎么看进度啊，要等多久啊？