5 可不可以用转录组重测序的原始数据来分析其中microRNA等ncRNA的变化差异?

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最佳答案 2018-07-27 10:00

lncRNA 为长链非编码RNA,长链非编码RNA有带polyA结构的,也有不带polyA结构的,常规的转录组mRNA建库会使用ployT磁珠筛选mRNA,理论上那些带ployA尾巴的lncRNA也会存在于普通mRNA转录组测序的数据当中,是可以分析这部分内容的,但是会丢掉很多lncRNA的信息。通常测lncRNA公司会建议多测一些数据,以检测那些表达量较低的lncRNA。

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其它 2 个回答

microRNA

不可以。

虽然microRNA 的转录也会有ployA这样的结构,理论上通过转录组测序,能检测到miRNA前提的转录本,但是:

1. 常规转录组建库,筛选的片段都在大于200bp, 很多miRNA的前天就被筛掉了

2. miRNA的前体会进行加工剪切为成熟的micoRNA。 成熟的microRNA才是起功能作用的分子。

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张文瑾

那LncRNA可不可以呢?

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  • 张文瑾 提出于 2018-07-11 09:40

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