在绘制LD block过程中，输入LDBlockShow -InVCF $vcf -OutPut LD -Region Chr6:1413298-1613298 \ -OutPng -SeleVar 2 然后显示没有snp，然后无法绘图。但是我用vcftools提取该范围的vcf文件，是存在snp的啊
平时工作学习中会需要将一些格式的文件转换为其它格式。这里有一款在线格式转换软件，可方便快捷的实现多数格式之间的转换： 地址：https://pdf2png.com/zh/ 可以实现很多格式间的转换，例如 PDF转 PNG、JPG，PDF转DOC、DOCX，HTM...
...骤和动态；可视化：数据可视化模块， 能在labelfree定量中呈现三维图形。视情况可不设置；组态：用于配置修饰、酶，以及数据库ID规则设置等，一般无额外需求，无需设置。 2.导入原始数据“Load”：将.raw文件直接导入软件，...
... 3. IPv4进行编辑： IP地址需要选择一个无其他人使用的 子网掩码长度如果是255.255.255.0，换算过来是24 4. 保存后即可使用 方法三： 1. 右下角wifi选项点击网络和internet设置 2. 选择网络重置，然后重启 3. 重新...
在进行基因上游顺势作用原件分析时，根据位置信息提取，promoter序列 1500，只能提取部分基因的序列，运行过程中遇到如下问题： 下面截图分别是基因在染色体上的位置信息以及基因组信息
...些基因已经有其他研究者研究过并对其命名的话，在文章中，我应该如何命名这些基因？
如何在GSDS中修改下基因名称呢，是修改gff文件吗，这是文件
在mfuzz分析完后，通过ClusterGVis可视化，但是出现了图片中的报错，开始以为是自己数据格式有问题，我替换了课程资料提供的示例文件，也出现同样的报错内容，请问怎么解决？
...小家族没有pfam号，结构域也是整个大家族共有的，现在用blastall（e-5，没筛比对率）找到了三百多个基因，去查大家族的结构域，最终筛到两百多个。但我查了一下在有研究过的物种内，这个小家族都是只筛到了十几二十个基因...
...来一篇2019年1月21日发表在BMC Plant Biology（影响因子3.93，中科院分区二区）上的转录组测序文章。该篇文章样品不多，思路明了，分析简单，没有过多的复杂的补充实验，值得借鉴；下面我们一起看一看这篇2019年转录组文章是怎...
...相比，它对检查点免疫疗法基本上没有反应。在这项研究中，我们使用来自 8 个原发性样本和 3 个转移性样本的 59,915 个肿瘤和非肿瘤细胞的 scRNA-seq 以单细胞分辨率询问肿瘤微环境。肿瘤细胞的子集分析证实了从批量分析中建...
... 利用 awk 将文件内分属不同类型的数据输入到不同的文件中。结合分类命名文件，批量完成。 以下方数据为例：数据以tab分隔，基于第二列新型分属不同类别，基于这些分类将数据拆分 写入不同文件。 Sme2.5_00225.1_g00009.1 5 ...
...enome.final.agp contig.fa genome.fa 得到：genome.final.chain 再用 liftover转换：http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/liftOver liftOver -gff contig.gff3 genome.final.chain genome.gff3 unmapped The arguments are: contig.gff3: scaffold annotations (INPUT)contig_t...
...广泛分布于亚洲、大洋洲和美洲，存在2000多个种，而在中国有超过7000年的驯化历史。目前对莲的研究集中于产量及观赏价值，对其种群历史以及与灭绝和适应相关的进化问题研究很少。 2022年武汉大学生命科学学院与广昌白莲...
使用方法： $Rscript ../scripts/ssGSEA.r -husage: ../scripts/ssGSEA.r [-h] -i expset -g geneset [-o outdir] [-p prefix]ssGSEA免疫侵润分析optional arguments: -h, --help show this help message and exit -i expset, --expset expset inpu...