找到约 15 条结果

文章 Oncomine数据库介绍

...第三步,寻找共表达的基因。 第四步,确定目标基因在细胞系中是否高表达 第五歩,基因表达与生存的相关性

文章 linux NFS 服务手动挂载nas文件

...k 避免有些任务卡住不动 NFS文件系统挂载与卸载 #挂载格式:mount -t nfs 服务器地址:/共享目录 /本机挂载点 #卸载格式:umount 挂载目标 将【服务器server】共享目录挂载到本地的/app/test目录 mount -t nfs 10.1.1.2:/export_data1 /share/...

问题 老师您好,我是刚接触生物网络分析的小白,在我做otu table 共存网络分析时出现下面这种情况:

...代码都可以正常运行,但是我却不行,我猜想可能是数据格式的问题,但是修改了很多遍依然没能解决这个问题,希望老师可以不吝赐教,谢谢

问题 conet构建网络图参数设置

...间的spearson 系数,如下图。我想问一下,在制图过程中,怎么设置这个ρ和p的范围呢,是在conet 的method mean这个菜单中填入相应的值吗,还有permutations和bootstrap这个值是怎么设置的呢?那个spearson correlation 在计算之后又是如何查...

文章 PASA报错:unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc

...个方面进行基因结构注释,其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错: 把三代转录组数据投入PASA是出现报错:unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc 报错原因: 1. 转录本fasta文件存在名字相同的序列 2. 转录本...

文章 心塞!比利时天才儿童9岁就读博,而有人读博15年还毕不了业......

...it上的网友也表示共鸣: 翻译一下: “他计划攻读电气工程博士学位课程,同时再学个医学学位。而我,直到39岁才终于拿到了文学学位……今天早上我还把衬衫穿反了。” 再来对比一下前段时间的一个新闻: 延边大学...

问题 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后,染色体出现了一个超级染色体,各染色体大小分布非常不均匀

...acpio和hic数据,根据咱们的T2T课程,主要利用hifiasm和Allhic软件进行初步组装和染色体挂载,结果显示19条染色体大小极不均匀,出现了一条超级染色体,如下图:希望帮忙看看分析代码问题(附件:1组装流程简化.sh),下文为简...

问题 老师,您好,我有一个问题不知道怎么解决,想要问您一下 我在学习基因家族分析的课程中,按照课程对WRKY家族分析,最后将WRKY_pep_need_to_confirm.fa文件输入CDD检测时和老师得到的结果不一样,一个domain都没有搜到,用smart搜索结果是和老师做的一样,为什么用CDD搜不到呢?图片中是我搜到的结果,右边框框中都是零,我换了老师做出来的这个文件搜索也是这个结果,这是为什么呢?

文章 微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0

...分析:omicsclass/ampliseq:v2.0qiime2 更新到最新版本(2023.7)其他软件更新到最新版本(faprotax,Lefse,PICRUSt2等)绘图脚本美化更新升级等 镜像更新v2.0: docker pull omicsclass/ampliseq:v2.0docker run -it -v ~/ampliseq:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 视频课...

问题 基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?

...,如图,黄色标记的是含部分结构域的基因。这些基因我怎么取舍呢? 如果62个基因都拿来进行下一步分析吗,命名有什么规则吗?我做的是SBP家族,是根据我的unigene的名称排序依次命名呢?还是先将这些基因和拟南芥的SBP...

文章 转录组分析基因注释常用的数据库

...的数据库,按照三大类别BP(生物学过程), MF(分子功能), CC(细胞组分) 对基因的产物-蛋白质进行了分类;并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准. 在GO数据库中,本质上是一个有向无环图的数据结构,在三大类别之下,又有...

问题 求助:Docker启动不了了。

...命令在运行hyper-V。。这个选项我关不掉。 现在不知道该怎么处理了。。 请老师帮忙看看,怎么样才能使我的电脑能正常使用docker toolbox呢?  ………………………………………………………………………… 我的电脑的虚拟...

问题 如果提取基因一条代表CDS序列不成功,mRNA与CDS,GENE的ID都不一致(马铃薯数据库)

...ID呢   ST_PGSC_DM_v3.4_cds.fasta中的序列开头是>cds mRNA(格式), 如果可以让它们前后交换也可以,这样就可以用mRNA提取了 相关脚本.rar(geneid_to_mRNAid.pl为原脚本,另外两个为修改后运行不成功的脚本)

文章 常用的抗体亲和力成熟技术有哪些?

...   ③定点突变 由于天然抗体在亲和力成熟过程中,体细胞高频突变发生区域并非均匀分布,而是主要集中在与抗原直接接触的CDR区。在抗体的亲和力体外成熟过程中,CDR区是最常选用的定点突变区域,这样既可以获得足够的...

文章 linux命令之AWK

...文件时不会出现内存溢出或是处理缓慢的问题,通常用来格式化文本信息awk处理过程: 依次对每一行进行处理,然后输出awk命令形式:awk [-F|-f|-v] ‘BEGIN{} //{command1; command2} END{}’ file [-F|-f|-v]   大参数,-F指定分隔符,-f调用脚本...