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问题 老师,我做基因上游顺势作用元件分析时出现这种情况是什么意思啊?

问题 如何获取顺势作用原件分析的gene.bed和feature.bed文件

问题 做pca分析,报错,提示row.names,这个是什么意思,要怎么解决

问题 泛基因家族成员选择压力分析中,构建的热图,很奇怪,我需要如何更改?

问题 新上的空间转录组课程可以用于分析华大基因测的数据吗

问题 bio-linux ova包在百度网盘的pan.baidu.com/s/1bMOLEu这个地址已经没有了?怎么办?如何找到bio-linux ova包?

 我看组学大讲堂“Linux生信分析环境搭建”一节里,安装bio-linux需要它的ova包,可是提供的下bio-linux ova包的百度网盘地址:pan.baidu.com/s/1bMOLEu,已经存在这个资源文件了,怎么办?求解决办法。

问题 做植物BSA集群关联分析的时候,取样有什么原则?

我手里有一个F2性状分离群体,想问下如果使用BSA方法去做基因定位的时候,每个混池应该取多少样品比较合适?重测序的时候深度怎么选择?

文章 浅谈几种常用的蛋白互作实验研究方法!

...子生物学研究方法的发展,很多的研究领域都越来越多的分析到了蛋白层面,下面我们就简单介绍几种常用的蛋白互作研究方法: 酵母双杂交: 酵母双杂交由Fields在1989年提出,它的产生是基于对真核细胞转录因子特别是酵...

问题 做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?

老师您好,我看到您在2021-03-20提问的问题:在做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?我也遇到了相同的问题,请问您后来如何解决的呢?感谢您!

问题 基因家族分析 基因家族基因在同物种之间的进化同源关系

老师您好,我在跟着视学习基因家族分析,做到基因家族基因在同物种之间的进化同源关系这一步最后画图时,现如下问题: 我一共做了5个物种的比较,以下是我的文件内容截图: 我看主要是TAO和FN的基因在bed文件...

问题 群体遗传进化分析 W文件中的PCA代码 出现bug

按着视里面操作但是 无法运行,只要是和plink有关的都行,  进化树可以正常运行

问题 泛基因家族-结构分析

老师, 我的泛基因组中,有三个品系的基因组命名有“_”,如图所示。 所以我进行这个操作时那三个品系都被删除了,我应该怎么改一下"s/_/\t/g"|这个命令啊。 #提取基因的位置坐标信息 cat ${svgene}_gene.list|sed "s/_/\t/g"|while ...

文章 IF5=7.8 |骆驼蓬属(Peganum)染色体水平基因组组装与群体遗传进化分析

...文,文章通过组装染色体水平物种基因组,群体重测序等分析,首次揭开了骆驼蓬属物种的起源、分化历史及适应性进化机制,并提出创新性的“混合-隔离-再混合 ”(MIM)循环模型” 01 — 研究背景 骆驼蓬属是中亚干旱...

问题 在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候,需要加入Q矩阵,有一个疑问

在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候,需要加入Q矩阵,有一个疑问。为什么这个命令中,cat ../03.STRUCTURE/admixture.4.Q|cut -d " " -f 1-3 >4.Q。用的是admixture.4.Q的结果,是跟群体结构的CV error有关吗?而且后边为什么只取了前3列,生成4.Q...

问题 IsoSeq3分析中用lima去除测序引物和barcode没有结果

在用IsoSeq3分析时 1)ccs --minLength=200 --minReadScore=0.75 --minPredictedAccuracy=0.8 --numThreads=20 --noPolish --minPasses=1 --reportFile=test.ccs_report.txt test.subreads.bam test.ccs.bam  2)lima test.ccs.bam adapter.fasta test.demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi  在第二步生成的...