我看组学大讲堂“Linux生信分析环境搭建”一节里,安装bio-linux需要它的ova包,可是提供的下载bio-linux ova包的百度网盘地址:pan.baidu.com/s/1bMOLEu,已经不存在这个资源文件了,怎么办?求解决办法。
我手里有一个F2性状分离群体,想问下如果使用BSA方法去做基因定位的时候,每个混池应该取多少样品比较合适?重测序的时候深度怎么选择?
...子生物学研究方法的发展,很多的研究领域都越来越多的分析到了蛋白层面,下面我们就简单介绍几种常用的蛋白互作研究方法: 酵母双杂交: 酵母双杂交由Fields在1989年提出,它的产生是基于对真核细胞转录因子特别是酵...
老师您好,我看到您在2021-03-20提问的问题:在做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?我也遇到了相同的问题,请问您后来如何解决的呢?感谢您!
老师您好,我在跟着视频学习基因家族分析,做到基因家族基因在不同物种之间的进化同源关系这一步最后画图时,现如下问题: 我一共做了5个物种的比较,以下是我的文件内容截图: 我看主要是TAO和FN的基因在bed文件...
按着视频里面操作但是 无法运行,只要是和plink有关的都不行, 进化树可以正常运行
老师, 我的泛基因组中,有三个品系的基因组命名有“_”,如图所示。 所以我进行这个操作时那三个品系都被删除了,我应该怎么改一下"s/_/\t/g"|这个命令啊。 #提取基因的位置坐标信息 cat ${svgene}_gene.list|sed "s/_/\t/g"|while ...
...文,文章通过组装染色体水平物种基因组,群体重测序等分析,首次揭开了骆驼蓬属物种的起源、分化历史及适应性进化机制,并提出创新性的“混合-隔离-再混合 ”(MIM)循环模型” 01 — 研究背景 骆驼蓬属是中亚干旱...
在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候,需要加入Q矩阵,有一个疑问。为什么这个命令中,cat ../03.STRUCTURE/admixture.4.Q|cut -d " " -f 1-3 >4.Q。用的是admixture.4.Q的结果,是跟群体结构的CV error有关吗?而且后边为什么只取了前3列,生成4.Q...
在用IsoSeq3分析时 1)ccs --minLength=200 --minReadScore=0.75 --minPredictedAccuracy=0.8 --numThreads=20 --noPolish --minPasses=1 --reportFile=test.ccs_report.txt test.subreads.bam test.ccs.bam 2)lima test.ccs.bam adapter.fasta test.demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi 在第二步生成的...