找到约 15 条结果

问题 你好,刚才那个问题写的乱了,Univar

Error in parse(text = x, keep.source = FALSE) :    <text>:1:9: unexpected input 1: mysurv~1_             ^  这是怎么回事,怎么纠正

文章 IF=13.8 | 甘油/二醇脱水酶是后肠发酵食肉动物肠道微生物群的关键功能

...α多样性在不同饮食和肠道生理之间没有显著差异,但其β多样性与饮食和肠道生理显著相关。此外,尽管组成α多样性在动物的粪便微生物群落中并未反映出pdu/cob-cbi-hem的多样性,但后肠发酵的杂食动物和肉食动物中,由pdu/cbi-c...

问题 老师,您好,最近做的bHLH转录因子的文章,我做序列比对的时候需要先知道它有几个亚家族吗是要从亚家族里边找出来几个氨基酸序列进行比对,怎么确认水稻和拟南芥属于这个亚家族,还是把物种的所有序列都比对,比如,拟南芥有二百多条,水稻有一百多条等,谢谢您

问题 qiime2 v1.4版,用data2生成特征表时出错,应该怎么解决? Plugin error from dada2: An error was encountered while running DADA2 in R (return code 1), please inspect stdout and stderr to learn more. Debug info has been s

文章 vcftools去除或保留vcf文件中的样品

...,也可将样品保存到文件 id.txt 中,每行为一个样品ID,格式如下: 1105 然后使用下面两个选项对vcf文件保留或者删除样品。 --keep <filename>   保留样品--remove <filename>   删除样品 代码如下: vcftools --vcf in.vcf --recode...

文章 Unicycler二代、三代混合组装

...com/rrwick/Unicycler.gitcd Unicyclermake 注意:需要自行安装依赖软件:spades、racon、pilon、bowtie2、blast、samtools、java、bcftools 二、Unicycler混合组装 组装命令 unicycler -t 50 \-1 clean_data/R1_paired.fq -2 clean_data/R2_paired.fq \-l clean_data/pacbio.fq -o...

问题 GWAS分析绘制进化树遇到下面问题是什么意思,请问怎么解决?

[root@9adc3a3663e0  00:27:42 /work/my_gwas/01.phylo_tree]# ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROU                                                                                                 P -g Group -n fasttree WARNING: ignoring environment value o...

文章 linux系统中ls命令的常用用

...一下ls 命令的使用方法。 一、ls命令使用介绍 ls命令格式:ls [选项] [目录名]。ls命令功能:列出目标目录中所有的子目录和文件。ls 命令的参数选项说明: -a,             列出目录下的所有文件,包括以 . 开头的隐...

文章 茶树在非生物胁迫下的转录响应

...潜在的下游基因(受调控的基因)主要涉及的功能包括了细胞壁的维持、根的伸长、膜蛋白、代谢以及解毒等等,其中很大一部分在不同浓度处理下出现了非常明显的上调或者下调,包括PGIP1(多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白1)、Exp...

问题 请问一下用CoNet构建网络没有环境因子表格可以做吗?一般用MENA、CoNet以及SparCC构建网络至少需要多少个平行??

我用CoNet构建的网络,一个处理5-8个平行,直接上传的biom格式以及直接下载的OTU表格去构建,设置好参数,没有添加环境因子,点击“go”,每次都出现error

问题 基因家族成员命名和定位

...果中(另一个物种)只有Protein ID,请问:(1)Gene name是怎么命名的呢?(2)文章中Locus ID 指的是我的结果中的gene ID 吗?(3)Scaffold的位置信息应该怎么查找呢?另外,请问老师这些表格中的信息是一个个粘贴过来的吗? ...

问题 泛基因家族分析结构变异分析,生成的mcoords和mdelta文件为空

...0 $query.delta > $query.mdelta      #转换成人类可读的表格格式   show-coords -Tclrd  $query.mdelta > $query.mcoords done

文章 在线绘制差异基因kegg注释图

...填充好了,如下图所示: 二、在作图网站填入数据: 打开网站:https://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 按照下方设置好参数,并将第一步准备好的Excel表里的第一和第三列数据粘贴进去(注意:Excel表的第一行和第二列都不...

问题 TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer

...wer 这2个选项,如图: 请问这是什么原因呢?我的TBtools软件是在基因家族分析课程里下载的。

问题 老师,您好!在进行不同物种之间的共线性分析时,当执行#绘制共线性图片:准备两个配置文件为输入文件: /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype --format=pdf --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout这个命令时出现了错误,绘制的共线性图也不对,这是怎么回事呢