找到约 15 条结果

文章 perl语言标量SCALAR

...1f           #十六进制,值为31   f不分大小写   2、浮点数也就是小数 11.40.3.33.5.4e2    # 540 e或E,+或-,e后面最多一到三位数字 -4.5E-2 #-450   3、注意 整数:最多15位 ,16位后截断 浮点数的精度:指数范围:-309~308 太小...

文章 GEO、TCGA多数据库联合挖掘胰腺导管腺癌预后关键基因

...互作网络(80 nodes and 930 edges,见上图B),从中选择出连接点数超过23的所有基因,一共涉及了42个基因,其中和基于模块和性状分析筛选的42个基因的重合有36个,该部分基因将作为候选进一步验证。 4.筛选与验证36个候选基因,利...

文章 ifconfig不显示ip

... ipv4.method autonmcli con up en1 执行这个代码,赋予他一个自动分配的ip就好啦

文章 一条命令筛选基因组指定区域内的所有基因

linux中的awk命令可以非常简单的实现搜索基因组指定区域的所有基因。具体方法如下。 首先要准备基因组gff文件,如下: 然后运行如下命令: awk '$1 == "1" && $3 == "gene" && $4 >= 10000 && $5 <= 200000 {print $0} '...

文章 parted磁盘分区 格式化,挂载

...量  (4)当数据写入到Ext3文件系统中时,Ext3的数据块分配器每次只能分配一个4KB的块  2. EXT4  EXT4是Linux系统下的日志文件系统,是EXT3文件系统的后继版本。  (1)Ext4的文件系统容量达到1EB,而文件容量则达到16TB  (2)...

问题 各位大佬好!我在筛选一批转录组数据里的差异基因时,当进行到构建dds对象的时候,r语言出现以下报错,说“一些值不是整数”,当我上网查这个错误的时候,有人说是“数据进行归一化,无法进行DESeq2分析”,请问各位大佬,还有什么解决方法嘛??谢谢谢谢

问题 用string网站预测蛋白质互作网络,为什么相隔两个月预测的两次结果不一致?

...的操作,hide disconnected nodes in the network后有63个节点,节点数没有减少;这两次使用的是同一个蛋白序列fasta文件,选择的是同一个物种,步骤是一样的,但是结果却不一样。想问一下为什么会出现这种情况?还是我哪个步骤出了...

问题 数据筛选

老师我有个蛋白 通过ncbi结构域搜索之后没有目标蛋白domain 但在注释文件中注释为我需要的目标蛋白 该怎么办

文章 JGI-IMG微生物功能基因组数据库介绍

...息等,目前仅细菌基因组收录的数目超过8万多。在IMG搜索页面(Find Genomes),每个条目均可排序筛选,查询搜索十分方便,且基因组信息可以很方便的输出。 还有关于细菌功能的收录整理:

问题 下载docker是出现这个问题

docker: error pulling image configuration: download failed after attempts=6: dialing production.cloudflare.docker.com:443 no proxy configured: connecting to 69.171.247.32:443: dial tcp 69.171.247.32:443: i/o timeout.

文章 Linux主分区、扩展分区、逻辑分区 区别与联系

...,四个主分区记录区仅使用其中两个,P2通过扩展分区,分配出五个逻辑分区。 扩展分配的目的是使用额外的磁区来记录分割信息,扩展分配本身并不能被拿来格式化。 其在Linux系统中文件名如下: P1: /dev/hda1 P2: /dev/hda2 L1: /...

文章 进化树构建方法及原理

...列上存在较多的回复突变或平行突变,而被检验的序列位点数又比较少的时候,最大简约法可能会给出一个不合理的或者错误的进化树推导结果。 第四种:最大似然法 依据:这个方法最早是遗传学家以及统计学家罗纳德·费雪...

文章 NCBI 中搜索某类基因蛋白序列技巧

有时候做基因家族分析分析的时候,我们需要搜索一类基因,比如某类基因家族基因做为种子序列,然后在自己的基因组或者蛋白序列中鉴定是否也存在这类基因,例如下面这篇葡萄中的基因家族鉴定,就是从NCBI上获得拟南芥...

问题 基因家族成员的筛选

麻烦咨询一下大家:我的基因家族根据HMM模型搜索得到,因为家族是一个外泌蛋白家族,根据NCBI-CDD都有保守域,那我可以根据预测信号肽的方法来去除一些没有信号肽的序列吗?这样做有意义吗?

问题 对于同一种系来源的生物体的基因组(比如都是人类的基因组),我要进行连锁不平衡分析,不同批次的数据对连锁位点的判断相同吗?

具体来说我想用plink删除基因组上连锁不平衡的位点,但我两份数据的位点数不一样,用同样的参数可以得到同样的连锁不平衡位点的集合吗?