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问题 基因家族分析时用大豆gff文件报错 killed

老师您好,我在进行大豆基因家族鉴定时,数据准备过程中想要进行“保留蛋白编码基因”出现报错“=> Version of the Bioperl GFF parser selected by AGAT: 3 gff3 reader error level1: No ID attribute found @ for the feature: 1    ena_assembly_gap        bi...

文章 读博的目的,就是为了进高校当老师?真相是——

...。 大学老师的收入高吗? 学霸姐姐在网上也看了一些数据, 一个985/211的博士生刚工作,如果是在一个普通高校当讲师,大概年薪在8-15W之间, 有少量的安家费和科研启动资金,不会很高, 压力还特别大,为了评上副教授...

文章 探讨敏捷开发在软件开发中的应用

...搞定后,再进行概要设计(UE设计、UI设计、交互设计、数据库设计、框架设计),概要设计完成后再进行详细设计……这样一个周期下来,耗费太长,当进度进入下一阶段,当上一阶段有问题时,会影响到整个项目流程的各个...

文章 泛基因组视频课程介绍

...组(graph-based assembly)。 迭代组装指将多个样本的下机数据比对到一个参考基因组后,将未比对上的reads组装成新的contigs。通过将这些新的contigs添加到原始的参考序列中,就可以构建一个泛基因组;多个体De novo即对多个样本同...

文章 linux下samtools安装指南

...与已知序列信息的基因或基因组进行比对)是高通量测序数据分析中最重要的一环,无论是转录组还是重测序都是基于比对结果来进行后续各项分析的,比对结果格式比较常见的是sam和bam文件,例如转录组Tophat分析软件输出的比...

文章 Nature | 获得学术成功的3个技巧——享受社交生活很重要!

...此类活动。因为你的大脑需要休息,在分析了三个小时的数据之后,你的大脑会不再清晰思考,并开始犯错,这个时候站起来去活动一下,工作会更高效。通往成功的道路上不只是苦,还有甜古话说“吃得苦中苦,方得人上人”...

文章 地球上物种总数到底有多少??

...个地点的真细菌、古细菌和微小真菌的20376项调查获得的数据汇集在一起,使用比例定律(scaling law)和一种生物多样性模型的混合分析方法对微生物总数进行了预估,结论是地球上的微生物物种总数约为 100000000000~1000000000000之...

文章 科研小白:生物实验做不出来是种什么体验?

...ts lift the lid on reproducibility”的文章, 文章中公布的一项数据让学霸姐姐“豁然开朗”: 超过70%的科研工作者,在尝试重复另一位科学家的实验时以失败告终; 超过50%的研究人员未能复制自己的实验。 你看,这不是很正常嘛...

文章 论文作者署名:导师和学生之间的一场大战

...气呵成的。 比如这篇文章的思路,设计,经费和条件,数据,整理和写作等等好几个环节,应该不太可能完全出自你一个人之手, 因此判断一篇文章的作者贡献程度是复杂的。 但是文章的作者排序又和我们的奖学金,毕业等...

文章 Win10家庭版也可以装Docker桌面版了!

...ditionId 选择“修改”,在弹出的对话框中将第二项“数值数据”的内容改为Professional,然后点击确定。 注意,这个修改会在电脑重启之后恢复原状,所以修改之后请安装成功docker后再重启电脑,否则需要重新操作该步骤。 4. ...

文章 超大基因组,超长染色体,凤丹牡丹基因组怎一个难字了得!

...了深入了解凤丹牡丹基因组的进化史,研究者进行了多种数据、多种角度的科学论证。首先通过比较基因组分析发现,除γ-WGD外凤丹牡丹没有经历额外的WGD事件,LTR插入到凤丹牡丹基因间区并进行大量复制,驱动了其大染色体和...

文章 微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

...f}myorder<-xdf[,1]myorder<-setdiff(myorder,c("Other"))#myorder#绘图数据准备mdf<- melt(xdf,id.vars=colnames(xdf)[1])colnames(mdf)<-c("OTU","sample","value")#指定柱状图中分类顺序if ("Other" %in%mdf$OTU ){mdf$OTU<-factor(mdf$OTU,levels=c("Other",rev(myorder)),ordered=T)}e...

问题 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

...基因组作为test时,能够成功生成gvcf文件,但用我自己的数据跑时,就一直报错。并且我用之前跑过的文件来test,也是失败的。麻烦老师帮忙看看可能是什么原因导致的呢?

文章 比较好发、版面费又便宜的期刊推荐?

...商或学会持有所有权,他们的盈利主要来自于图书馆订购数据库。但也不排除适当的期刊发展经费支持能够提升进一步沟通的几率目前很多期刊支持OA出版,发表文章需要支付APC,价格浮动也比较大,2000美元-5000美元/篇比较常见...

文章 CAR-T质量检测ELISA试剂盒常见问题解析

...计预实验测量计算。     7、加完终止液之后测的几次数据差别也蛮大?   答:加完终止液后,显色反应也不是永远停止,形成的黄色颜色会随着时间延长继续加深,建议在15 min内读数。     8、副孔差别比较大,是没洗...