找到约 15 条结果

问题 求助大佬，使用服务器分析基因家族问题

... 怎么在没有root权限情况下安装perl模块？如果有基因家族分析的脚本中需要的模块有个名称汇总就更好了

问题 重测序数据可以用来做基因家族的共线性分析

我看在比较基因组或者基因家族鉴定中有这一部分的分析，请问老师，手头上只有重测序的数据，又想看看某个基因家族是否扩张和加倍的话，可以怎么入手呢? ?

问题 老师好，请问共线性分析得到的collinearity文件里面的基因对是哪种基因对呢？segmental基因对还串联重复基因对或者其他的？

老师好，请问共线性分析得到的collinearity文件里面的基因对是哪种基因对呢？segmental基因对还串联重复基因对或者其他的？在tendom文件里并没有我的基因家族，所以想利用mcscanx分析得到的文件进行kaks分析。kaks分析可以用segmental...

文章 宏基因组结果解读和个性化分析课程上架

...序技术的普及，越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。 但是，有相当一部分研究人员由于是初次接触宏基因组分析，对分析结果缺乏系统的了解，无法高效的挖掘和研究目的相关的结果，进而影响了文章的发表以及成...

问题 只有基因组草图没有染色体级别的基因组可以做基因家族分析吗？？？？

目前研究的植物材料只有基因组草图，没有染色体级别的基因组，无法做染色体共线性分析等，只能做motif预测、进化树、启动子预测，基因理化性质与结构预测，定量分析等这样水平的论文能发什么档次的期刊呢？

问题 我做的是Smartseq3，请问分析的流程和10xGenomics 一样么

比如数据提取过程，分析过程等

问题 illumina芯片矫正

老师，您好，不知道您能不能解答，我先问下，illumina芯片矫正的时候，只有sample的值和Pvalue值，您课堂给的例子，每个sample都有信号值，但是我这些样本都没有信号值，请问怎么矫正？不知道老师有没有发现这个问题  我选的...

文章 cBioportal使用教程

...数据的探索，可以允许跨gene，样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式，并比较点多癌症研究中gene改变频率，或者在一个个体肿瘤样本中总结概括所有的相关的基因组改变。这个...

问题 做GWAS分析的vcf文件具体是哪一个呢？

做GWAS分析的vcf文件就是gvcf直接合并的raw.vcf文件还是经过过滤后的clean.vcf文件呢？需要将snp和indel分离吗？

问题 结合转录组分析基因家族

老师，您好，我下载了别人发表的转录组数据，想拿结合做热图，但是文件太大，有十几个G，这样的文件该怎么打开筛选表达量数据呢

问题 MolQuest软件的使用

想请教一下MolQuest里对核酸序列和氨基酸序列的结构域分析、染色体定位分析、共系分析、蛋白质互作分析、蛋白质三级结构分析，具体的一些操作和参数的设置

问题 关于转录组结果分析视频中FPKM值的意义

老师您好在无参转录组视频基因表达分析的学习中，碰到了FPKM和TPM值，有等于0的，也有大于1，甚至大于10的， 请问这代表什么意思？ 我的理解是：大于0表示基因表达，值越大表达水平越高，请问老师，这样理解可以吗？

文章 2020年读研还有用吗？工作 or 读研，到底选啥？

...闻事件，比如： ——69名准研究生爽约湖南大学 “录而不读”，被取消入学资格； ——广州大学72名研究生被退学； ——硕士研究生招生人数中女生的占比越来越高； ——各高校硕士研究生补贴越来越高； ——各大城市研...

问题 镜像加速接下来怎么操作

看了docker在windows系统和mac系统中安装 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)这个帖子，但页面不一样，不知道接下来怎么操作，求解答，感激。

问题 学习有参转录组分析中遇见的问题

老师，您好，我在做转录组有参分析的过程中，跟着老师的步骤操作，但是第一个问题就难住了我，我在使用hisat2_extract_splice_sites.py的时候，系统提醒这个命令找不到，如图片所示，这是怎么回事呢？我用的是Linux系统虚拟机操...