学习有参转录组分析中遇见的问题

老师,您好,我在做转录组有参分析的过程中,跟着老师的步骤操作,但是第一个问题就难住了我,我在使用hisat2_extract_splice_sites.py的时候,系统提醒这个命令找不到,如图片所示,这是怎么回事呢?我用的是Linux系统虚拟机操作的。感谢回答!attachments-2020-03-aNROOHTU5e5e79870e5f1.png

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

二代测序转录组数据自主分析 这个课程学习需要有一定的linux基础,基础薄弱可能跟不上老师的课,建议学习:linux系统使用

你这个问题需要自行安装 hisat2软件,并且把软件的安装目录添加到环境变量PATH中才行;


更多生物信息课程,建议学习:

生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用biolinux搭建生物信息分析环境linux命令处理生物大数据perl入门到精通perl语言高级R语言画图R语言快速入门与提高python语言入门到精通

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,1818 浏览
  • 提出于 2020-03-03 23:37

相似问题