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文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌（HCC）(GSE149614)

...le \ --vars.to.regress nUMI percent_mito --high.variable.genes 2000 结果展示： 单细胞转录组分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

文章 高品质抗体推荐：乳腺癌研究的最新抗体有哪些？

...的抗体。 3，详细的试验数据 全面精确的WB试验条件及结果数据(为每个WB体提供相应的WB试验操作指南)。 4，专业的乳腺癌综述 资深研发人员自主撰写，梳理各个指标之间的信号串扰关系，方便对乳腺癌研究进行系统性的学习...

文章 植物科学常用数据库和生物信息学工具

...系统树的网络工具     https://itol.embl.de/    iTOL：用于显示，注释和管理系统发育树的在线工具     https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/ OrthoVenn2：多物种直系同源基因簇比较和注释在线服务工具     http://bioinformatics.cau.edu.cn/ARSER...

文章 获取关系矩阵（WGCNA)

...dPvalue：pearson 计算关系矩阵，同时可以获得pvalue值，返回结果是一个列表，包括关系矩阵cor以及p值矩阵等等。。。 > correlation_pvalueDat1=corAndPvalue(dat1,method="pearson",use="p")> correlation_pvalueDat1$cor            A         ...

文章 IF=3.47|非肿瘤-眼部老年黄斑变性ceRNA文章思路

...自GEO两个表达数据，包括AMD患者和正常对照：    主要结果： 1.两个数据集，分别以患者和对照为分组筛选差异基因： 2. 共有的差异表达基因（107个）表达热图展示: 3.差异表达基因GO富集分析，展示前10个最富集的ＧＯterm：...

文章 第11期《基因家族分析实操培训班》邀您参加！

...究打下基础。 基因家族的分析内容都包括哪些呢？ 1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域，鉴定基因家族成员； 2、预测基因家族成员的顺势作用元件； 3、构建系统进化发育树； 4、基因家族成员MOTIF分析及绘图； 5、...

文章 network.r绘制网络图并输出最大子图节点及网络图

...注-S  是否标注最大子图中节点名，默认标注使用举例：结果展示：完整网络图最大子图：

文章 史上最有个性的论文盘点，你一定没见过！

...手工运算，然而，这个数值与如今超级计算机计算出来的结果完全一致。1947年，这个发现进入了地震学的权威教科书，也算是一段传奇了。2，最有“脾气”的论文摘要论文标题：LQG调节器的保证裕度摘要：“不存在(There are none)...

文章 亚型划分比较波浪图（桑基图）绘制

...tadata_group.tsv -g m6acluster Immune_Subtype group -c m6acluster -p demo 结果展示： 输入文件准备 这个脚本需要一个输入文件即可，由-i参数指定，格式如下 更多脚本参数设置及说明 通过-h参数获得以下帮助信息。 usage: sankey_plot.r [-h] -...

文章 enrichKEGG_pip.r KEGG 富集分析

...lueCutoff 0.01 --ann.db org.Hs.eg.db --organism hsa \  --idtype SYMBOL 结果展示： 参考文献： Yu G, Wang L, Han Y, He Q (2012). “clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters.” OMICS: A Journal of Integrative Biology, 16(5), 284-287. d...

文章 TCGA SNV 体细胞突变下载

... Mutation",  access = "open")GDCdownload(query )# 保存整理下载数据结果maf.data <- GDCprepare(query )write.table(data.frame(maf.data,check.names = F), file ='maf.tsv', sep="\t",row.names =F, quote = F)####################################################################### maftools plot#...

文章 GSDS网站docker镜像本地构建

...的专门为GSDS定制的docker镜像 > docker search omicsclass   #搜索镜像NAME                           DESCRIPTION                                     STARS               OFFICIAL            AUTOMATEDomicsclass/gene-family         gen...

文章 胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-糖酵解

...预后显著相关的基因：Lasso  cox 回归分析：从单因素分析结果的12个GRGs中，挑选出7GRGs构建最优的预后模型：Risk score（RS） = 0.170 × expression of STC1+0.215 × expression of CLDN9-0.111 × expression of EFNA3-0.546 × expression of ZBTB7A+0.234 × expression...

文章 深入理解Linux shell中2>&1的含义 标准错误输出与输入

...t;log (1指向log，2还是指向屏幕) 所以这就不是我们想要的结果。 简单做个试验测试下上面的想法： java代码如下： public class Htest { public static void main(String[] args) { System.out.println("out1"); System.err.println("error1"); } ...

文章 如何用R语言绘制进化树+热图

...名称 -H 设置图片高度 -W设置图片宽度 -o 输出目录 结果：