找到约 15 条结果

文章 pubmed按影响因子分类文献

...人都需要用到PubMed,功能非常强大,绝大多数的文献都能搜索得到,但是pubmed的高级功能可能很多人还不知道->那就是自定义筛选条件:最好的应用就是将文献按照影响因子进行分类,如下图所示: 做到这个只需简单三...

文章 split_sample.r根据生存数据对样本随机分组

..._sample.r -i ../project/zx-20210908-381-TCGA_CHOL/01_meta/survival_time.tsv结果展示:

文章 linux用户管理命令介绍

...oup 找到GROUP1那一行,删除 A或者用命令gpasswd -d A GROUP 8、显示用户信息id usercat /etc/passwd 更详细的用户和用户组的解说请参考Linux 用户和用户组详细解说本文主要讲述在Linux 系统中用户(user)和用户组(group)管理相应的概念;用户(u...

问题 根据log文件判断进化树最佳模型

...的log文件后没看到这几个单词,您可以帮我看一下我这个结果里面哪个代表了最佳模型吗,谢谢老师 结果如下:  1 IQ-TREE multicore version 2.2.2.2 COVID-edition for Linux 64-bit built Nov 16 2022       2 Developed by Bui Quang Minh, James Barbetti, Nguye...

问题 WGCNA所用样本可以来源于不同实验(如发育时期、胁迫处理等)一块进行分析吗?只有一个实验的表型数据可以直接进行关联分析吗?

...3个重复(自测)(因为样品量只有4×3=12,单独进行WGCNA结果不太可靠); (2)5个发育时期,3个重复(NCBI); (3)胁迫处理和对照,3个时期,3个重复; 2、表型数据: (1)只有自测数据的4个发育时期的表型数据。注:...

问题 单倍型分析报错

...TRUE和na_drop = TRUE改成:hetero_remove = FALSE,na_drop = FALSE,但结果还是会报错。 报错界面如下: 运行的命令如下: Rscript /work/scripts_v2/hap_analysis.r -v site.recode.vcf -g $GFF -p $trait4 -G data/group_delete.txt -c 7 -s 207511 -e 207555 其中的site.recod...

文章 选生物专业怎么样?就业前景好吗?

...喜欢的专业而后悔莫及。 根据往年《高招调查报告》显示,仅15%的学生有明确的专业方向,超85%的考生盲目选择大学专业, 有71%的大学生后悔选错了专业,超65%的大学生跨专业选择职业。 学霸姐姐表示:我就是那盲选专业...

文章 常见的预后预测的模型介绍

...作用,用于预测疾病进展、治疗反应和生存率等重要临床结果。根据数据类型、研究目标和所需的解释性,可以选择不同的统计和机器学习模型。以下是一些常见的预后预测模型    统计模型 Cox比例风险模型(Cox Proportional Ha...

文章 exp_immu_cor_plot.r 基因表达量与免疫侵润相关性绘图分析

... 1.187456 2.476138 0.366081 7.347344 -i 输入样本免疫侵润结果, 注意脚本会自动对两个文件里的样本取交集 cell_type TCGA-B7-A5TK-01A-12R-A36D-31 TCGA-BR-7959-01A-11R-2343-13 TCGA-IN-8462-01A-11R-2343-13 TCGA-BR-A4CR-01A-11R-A24K-31 B cell 0 0.0131...

文章 第三期《基因家族分析实操》直播课开始报名了!

...以下10个分析技能,您也能写一篇基因家族的文章啦!1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域,鉴定基因家族成员;2、预测基因家族成员的顺势作用元件;3、构建系统进化发育树;4、基因家族成员MOTIF分析及绘图;5、基因结构图...

文章 sankey_plot.r绘制桑基图

...data_group.tsv -g m6acluster Immune_Subtype group -c m6acluster -p demo 结果展示:

文章 重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

...据准备做完重测序分析后,我们可以得到包含 SNP的变异结果vcf文件作为输入文件。详见课程:重测序数据分析课程,然后利用omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3 镜像进行前期数据准备与后续进化树构建分析: #运行环境准备:docker镜像启...

文章 启动子序列提取-EPD真核生物启动子数据库!

...多个基因,选择自己感兴趣的即可,示例数据仅一个检索结果,直接给出了启动子序列信息页面,如下图,可在Sequence Retrieval Tool 下设置启动子序列提取范围,一般转录组起始点前1500-2000bp,设置好点击右侧的GET SEQL即可;还可...

文章 BSA分析之MutMap分析原理详解!

...近等基因池,这就排除了环境及人为因素的影响,使研究结果更为准确可靠。BSA法克服了很多作物难以得到近等基因系的限制,并且比近等基因系法省时省力,是一种非常实用的基因标记定位的方法,应用非常广泛。与BSA相结合...

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

... 1)首先系统中docker安装与使用方法见课程: 2)镜像搜索、下载、启动使用方法: > docker search omicsclass   #搜索组学大讲堂提供的所有镜像NAME                           DESCRIPTION                 ...