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问题 蛋白结构域完整性的验证

...用NCBI中的CDD工具发现它的NBS结构域是完整的，但是用Pfam数据库验证又不是完整的，让人很迷惑。 到底该怎样去判断一个基因中包含的某个蛋白结构域是否完整呢？

文章 Linux安装细胞器组装软件--GetOrganelle

...#安装和配置psutil和matplotlib包 二、配置GetOrganelle自带的数据库（SeedDatabase 和LabelDatabase） get_organelle_config.py --add embplant_pt       #配置高等植物质体基因组库get_organelle_config.py --add embplant_mt       #配置高等植物线粒体基因...

问题 关于wgcna模块内基因数目的问题

...于table出来的数目。 我不知道哪里出问题，我看也没有数据剔除。请老师回答下。

问题 ITS测序的OTU聚类分析

...程讲解了不建议生成该文件），但是出现了下图的报错（数据库我已经换成了unite），只生成了biom文件但是没生成“rep_set.tre”，请问是哪一步出错了，谢谢！

文章 R语言、ggplot2的简单绘图（1）

#包的安装 install.packages("ggplot2") #包的加载 library（ggplot2） #用内置数据画散点图 a<-ggplot(diamonds,aes(carat,price))#赋值给a a+geom_point() #出图 注：需在英文状态下输入 如果错误，请联系我，谢谢！先试试能用不这个！

问题 pi_smooth_line_plot.r作图问题

您好，课程中讲解的是将示例数据中的wild和cultivated两个文件分开作图的，请问可以将两个文件作到一张图么？

问题 qRT-PCR的结果中Ct值在25-32之间

如题，qRT-PCR的结果中Ct值在25-32之间，请问这样的数据能用吗？

问题 蛋白质全长多序列比对

...序列比对看看，结果发现序列缺失，如图：，但是前期在数据库看的时候确实有这个结构域如图，打开WRKY_pep_final_aligned文件后发现是这种情况：，但是其他序列比对后是，感觉是muscle -align WRKY_pep_final.fa -output WRKY_pep_final_aligned.fa...

文章 实用技术——Eclipse 常用快捷键

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 plink怎么设置样本的PPID，MID，Sex信息？

我的家系信息和性别信息在.ped文件中都是缺省值，但我实际的数据是有家系和性别的，保存在一个txt中，可以把他放到.ped文件中吗？

问题 我做的是Smartseq3，请问分析的流程和10xGenomics 一样么

比如数据提取过程，分析过程等

问题 老师我一个一个步骤进行，一个基因一个基因分析，是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因，代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码，前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

如果代码没问题，只能手动筛选么，怎么保存成domain_final.bed格式呀

文章 annovar的染色体识别问题

...释之前，要尽量把染色体改成数字的形式，如果是NCBI的数据，也可以查询到NC编号对应的数字：

问题 老师您好！

老师您好！我用你们提供代码在GDC里面下载数据时候出现错误，错误代码如下： GDCdownload(query = query, +             directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client') Downloading data for project TCGA-CHOL 试开URL’https://gdc.cancer.gov/files/...

问题 在转录组中找糖苷酶基因

老师：您好，我想在我的转录组数据中找相关的糖苷酶基因，由于基因组注释文件缺失，没办法利用基因组来找。我想知道用什么方法可以找全糖苷酶基因，望指教。我现在都是手动，从NR注释中查找与糖苷酶相关的基因，但是...