经常会遇到对bed文件或其他相关数据的排序，记录一下如何先按照染色体号排序，然后按照坐标位置排序。 sort -k1,1 -k2n file1 > file2 排序完成后如下：
...不同处理的卷丹百合样品进行转录组分析，获取基因表达数据并进行了差异基因分析，共筛选出 4389 个 DEGs，包括 2328 个上调 DEGs 和 2061 个下调 DEGs。聚类分析表明组间基因表达谱差异显著，而组内生物学重复性良好。功能富集...
...用NCBI中的CDD工具发现它的NBS结构域是完整的，但是用Pfam数据库验证又不是完整的，让人很迷惑。 到底该怎样去判断一个基因中包含的某个蛋白结构域是否完整呢？
...于table出来的数目。 我不知道哪里出问题，我看也没有数据剔除。请老师回答下。
...程讲解了不建议生成该文件），但是出现了下图的报错（数据库我已经换成了unite），只生成了biom文件但是没生成“rep_set.tre”，请问是哪一步出错了，谢谢！
...#安装和配置psutil和matplotlib包 二、配置GetOrganelle自带的数据库（SeedDatabase 和LabelDatabase） get_organelle_config.py --add embplant_pt #配置高等植物质体基因组库get_organelle_config.py --add embplant_mt #配置高等植物线粒体基因...
#包的安装 install.packages("ggplot2") #包的加载 library（ggplot2） #用内置数据画散点图 a<-ggplot(diamonds,aes(carat,price))#赋值给a a+geom_point() #出图 注：需在英文状态下输入 如果错误，请联系我，谢谢！先试试能用不这个！
您好，课程中讲解的是将示例数据中的wild和cultivated两个文件分开作图的，请问可以将两个文件作到一张图么？
如题，qRT-PCR的结果中Ct值在25-32之间，请问这样的数据能用吗？
...序列比对看看，结果发现序列缺失，如图：，但是前期在数据库看的时候确实有这个结构域如图，打开WRKY_pep_final_aligned文件后发现是这种情况：，但是其他序列比对后是，感觉是muscle -align WRKY_pep_final.fa -output WRKY_pep_final_aligned.fa...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
我的家系信息和性别信息在.ped文件中都是缺省值，但我实际的数据是有家系和性别的，保存在一个txt中，可以把他放到.ped文件中吗？
比如数据提取过程，分析过程等
...释之前，要尽量把染色体改成数字的形式，如果是NCBI的数据，也可以查询到NC编号对应的数字：
老师您好！我用你们提供代码在GDC里面下载数据时候出现错误，错误代码如下： GDCdownload(query = query, + directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client') Downloading data for project TCGA-CHOL 试开URL’https://gdc.cancer.gov/files/...