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文章 ggplot从数据到图形绘制逻辑

...作图并联合进行展示。分面也称为条件作图或网格作图。2、绘图步骤

文章 【深圳敏捷狂欢大会】腾讯P4/华为高级产品管理专家敏捷开发实战分享

...期日) 地址:(广东深圳)南山区软件产业基地5栋C座2层创展谷 报名链接:https://www.huodongxing.com/event/6506128760000 限时免费!想要参加的朋友尽快报名啦!

问题 利用perl脚本提取基因上游的1500bp(指定位置)序列时,输出文件总是空文件。尝试过很多办法无法解决

输入文件1-基因组文件如下图: 输入文件2-位置信息文件如下图:注,没有空格并且txt文本是excl文件另存制表符分隔 输出文件以及所敲指令-如下图:指令未显示报错,但是输出文件是空文件 所用代码: 所用数据从jgi...

文章 转录组测序分析数据库介绍

...。最顶层的三大分支视为level 1,之后的分级依次为level 2,level 3,level 4依次类推。通过GO注释,可以大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况。   GO数据库的术语形式是什么? GO定义的术语具有有向无环性(directed ...

问题 叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed,内存从10G改为30G又改成70G,但是还是不行,程序终止。

1、在get.sh.o文件中,出现:Retrying with more reads。 2、GetOrganelle_out文件夹中只有,没有组装的序列结果。

文章 如何绘制一份韦恩图

...之间的层叠关系,来表示集合与集合之间的相交关系。 2维韦恩图:咱俩谁跟谁,一目了然。 3维韦恩图:三分天下,相互牵制。 4维韦恩图:四海之内皆兄弟,你中有我,我中有你。 5维韦恩图:太复杂,不能再增加了,...

文章 基因家族复制基因查找之手动查找-blast

... 串联重复基因判断条件: 1,两个基因相似度大于75% 2,比对长度大于75%(相对于较长的基因) 3,基因在同一条染色体且距离小于100kb 参考文献如下: https://link.springer.com/article/10.1007/s00425-016-2575-6 blast手动查找方法...

文章 ifconfig不显示ip

...                           TYPE      DEVICE  eno1  1377a295-708b-4cb4-a1cb-04d8d58cc2bc  ethernet  eno1    lo    e9513de2-7f3b-4faa-a7c0-c8544e0bdcfa  loopback  lo      eno2  fe51385f-86b2-470d-a846-27c73ac4eff1  ethernet  --      eno3  f9129c6b-ca95-4d81-b165...

问题 motif绘图时,tbtools图上显示的motif跟meme.txt文件的不一致

...件放进tbtools里,图上显示几乎每个基因都有motif7、1、8、2,但是检查meme.xml文件和meme.html文件里只有部分基因具有这些motif,遇到这种情况怎么办?有没有遇到过相同问题的同学老师,麻烦指点一下~感谢感谢! tbtools生成图里几...

文章 miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

...目前已经更新到7.0 版本。收录的数据也越来越多。 2. 支持多方面的在线查询方式 支持针对miRNA及靶基因,代谢通路,验证方法,相关疾病等多方面的查询 3. 支持数据下载 在线查询,针对少量的miRNA,比较方便,但是如...

文章 生物信息分析用笔记本推荐-2020年618前夕

...正式开始! 中等性能 ①   品质之选:联想 小新Pro13 2020款,京东价格:5199 CPU Intel i5-10210U,内存16G,固态硬盘512G。京东链接:https://item.jd.com/100006859461.html 最新十代intel i5处理器,内存和硬盘都不小,虽然光看性能方面和...

文章 6分+文章告诉你2021基因家族分析文章还好发!

...家族分析相关的文章,历史文章总共有11948篇,非常多!2020年有1000多篇,今年2021刚刚过去一个季度就有300多篇,按这个速度,今年发表1000多篇想必也是妥妥的了!下面是搜索链接,大家可以复制到浏览器查看详情: https://pubme...

问题 用ALLHIC挂载时,划分Group出现问题

我组装的这个物种的基因组大小为 400 Mb,一共12条染色体,在 划分GROUP的时候,其中第一条GROUP很长,有 395 Mb,其余都很小。如下:       1.   sample.clean.counts_GATC.12g1   394863216       2. sample.clean.counts_GATC.12g10  160144    ...

问题 blastp提示ensemble中提取的序列文件不对

...g options 已去除序列中的终止子符号。 e.g: >ENST00000620518 ENSG00000081692  JMJD4 1:227732392-227735273(-) MDRETRALADSHFRGLGVDVPGVGQAPGRVAFVSEPGAFSYADFVRGFLLPNLPCVFSSA FTQGWGSRRRWVTPAGRPDFDHLLRTYGDVVVPVANCGVQEYNSNPKEHMTLRDYITYWK EYIQAGYSSPRGCLYLKDWHLCRDFPVEDVFTLPVYFSSDWLNEF...

问题 GEO数据库下载的表达矩阵转换成genesymbol。

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