问题 对于已经公布基因组的物种，如何制备染色体水平的GFF3文件？因为平台上不公布。

盐芥的基因组有新的到染色体水平的数据，但是没有基因的GFF3数据。如何获得或自己制备基因的GFF3文件，用于对基因家族的生物信息学分析？

问题 我下载了Mac版的clustalW的软件可是在第一步输入序列上出现问题，序列输不进去，希望能帮忙解答,谢谢

问题 LINUX系统操作这一节刚打开输入pwd时跟前方框里面不是share，是manger 为啥跟老师打开的不一样

问题 想请教下老师，我在合并完受选择区域后进行基因注释的时候一直是这个错误，不知道怎么解决，麻烦各位老师帮忙解答。

文章 导师放养，没有实验经费，该怎么办？

说起导师这种生物，大家恐怕都有吐不完的槽， 不管是好导师，还是“坏”导师，其实都是相对而言的， 一个尽职尽责的好导师，可能会让你披星戴月全天候做实验； 一个基本不露面放养型的导师，可能会让你自由自在颗粒...

文章 使用map()、filter()来做到函数式编程

...listlst_1=[1,2,3]print(num_1(lst_1))print(num_1(lst_1)) [2, 3, 4] [3, 4, 5] 这个普通函数经过2次调用，让lst_1这个列表的值发生了变化，那纯函数怎么写呢 def num_2(list): new_lst=[]for item in range(0, len(list)): new_lst.append(item + 1)return new_lstlst_1=...

问题 使用bio-linux中sratoolkit里prefetch下载数据，但是无法打开试过用自带的sratoolkit，也自己去下了个最新版的放在用户文件夹也不行，我按照网上的教程设置环境变量，用source ～/.zshrc使配置生效了（好像bio-linux用bashrc不行？），但是无论如何也打不开，不知道哪里出了问题，有大佬知道吗，小白实在不懂

问题 基因注释文件gff第9列，ID标签和parent标签与蛋白序列和cds序列里面的ID都不一致怎么办

问题 请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊

文章 bwa-mem2的用法

...1.3-3.1倍，具体取决于用例、数据集和运行机器，近期的版本极大降低了内存和存储使用量（使用了FM-index，和 8x compression） 最初的bwa是由李恒开发的. bwa-mem2的性能增强主要由英特尔并行计算实验室的Vasimuddin Md（@yuk12）和Sanchit ...

问题 R中apply同时计算行和列使用c(1,2)，为什么不起作用

> ma=matrix(c(1:4,1,6:8),nrow=2) > ma      [,1] [,2] [,3] [,4] [1,]    1    3    1    7 [2,]    2    4    6    8 > apply(ma, MARGIN =c(1,2),mean)      [,1] [,2] [,3] [,4] [1,]    1    3    1    7 [2,]    2    4    6    8 question：上述使用...

问题 有2个问题想请问老师，1基因名字字体过大，如何调整字体，2进化树分支线太短，看不清楚，如何将线拉长

提问.docx

文章 ifconfig不显示ip

...看一下,如果全是--,说明有问题了(我已经修好了,所以eno1不是--了,本来是),看好自己的网线插在哪个口,比如我是1 nmcli con mod en1 ipv4.method autonmcli con up en1 执行这个代码,赋予他一个自动分配的ip就好啦

问题 motif绘图时，tbtools图上显示的motif跟meme.txt文件的不一致

搜索10个motif，-minw 6 -maxw 100  生成meme.xml文件放进tbtools里，图上显示几乎每个基因都有motif7、1、8、2，但是检查meme.xml文件和meme.html文件里只有部分基因具有这些motif，遇到这种情况怎么办？有没有遇到过相同问题的同学老师，...

问题 基因ID和transcript ID 命名的方法不一致，导致了做出来的基因结构图出现了多个转录本结果 请老师指导，谢谢