问题 GO富集分析

请问一下在做GO富集分析的时候，标记的这里的gene ID怎么才能显示用于分析的gene ID啊，这样我才能知道那些基因对应那个GO term啊，谢谢！

问题 老师，请问串联重复基因由cds blast得到，而共线性分析由mcscan比对pep序列得到，请问一下这两个什么区别，为什么共线性分析我的基因家族（180个基因）只有一半染色体有共线性，是不是哪里分析出错了

mcscan分析蛋白序列得到circose blast得到串联重复基因

问题 老师您好，我想请问一下，通过分析找到的基因家族成员在NCBI上都是预测基因，继续分析没有问题吗

问题 做基因家族分析时，用MCScan做共线性分析，跟着教程走没有发现有串联重复的基因，这种结果正常吗？

问题 老师您好，我想问一个问题：这个python打印星号金字塔的过程中，如果i指星号数量，那么在金字塔中i的最大值为9啊。而且我不明白j的意义。这些问题我不太明白，请老师解答。谢谢老师

问题 WGCNA分析内存的问题

前段时间对80个样品，20000个基因进行WGCNA分析，可以顺利分析；最近对34个样品，14000个基因进行分析时，在计算TOM值时总出现“cannot allocate vector of size 1.6GB.”这是为什么呢？样品数和基因数变少却无法计算。（实验室服务器64...

文章 转录组结果解读及分析技巧

...组结果，知其然更要知其所以然； 二是自己掌握基础的分析技巧，打通从结果到文章的最后一步！ 为此，组学大讲堂（专业生信教程制作团队，学员已超25000人），基于主流测序公司交付的转录组标准分析结果进行了全面的解...

文章 不同的生存曲线含义 OS DFS

...死亡是任何原因导致的死亡都算进去，只关心是否死亡，不关心因为何种原因死亡。 2.disease specific survival Overall Survival：DSS 疾病特异性生存期，结局指标改变为 “由特定疾病导致的死亡”，这时候开始关心死亡的原因是否是由...

问题 我购买了你们基因家族分析的视频，但是看不太懂，有更详细的共线性分析配置文件的准备吗？

问题 单细胞转录组课程findallmarker中的KEGG和GO富集分析，对于不是模式植物的物种怎么进行富集分析

如何获取基因功能参考数据，如何导入进行富集

文章 从Windows粘贴到linux的内容行尾会有东西？

...判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在，结果总是不存在，然而明明就在啊，怎么会不存在呢，一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢？ chr01    1    00    ...    ...chr02    1    00    ...    ... 后来经过排查发...

文章 论文被拒稿11次，还有必要再投吗？

文章被拒稿，再正常不过了！ 通常情况下，一篇普通的文章大概会有70%以上的几率被拒， 学霸姐姐曾经看过一个小调查：平均一篇文章会被拒4-5次。 你的文章被拒过几次？你准备放手还是继续投？今天我们就来研究一下这...

问题 Ka/Ks结果分析问题

 老师，您好。请问一下：分析基因的选择压力时，Ka或Ks等于一方或双方都为0时，要怎么分析呢？ 

文章 svg2xxx运行报错

...全管理器已经被标记为过时（deprecated），并且在未来的版本中将被移除。这个异常提示是因为你的代码或者依赖的库试图设置或使用安全管理器，而这在最新的 Java 环境中不再被支持 解决这个问题的简单办法是在执行前将自...

问题 大麦基因家族分析时，进行基因结构分析时，hmmer提不到外显子gff文件是为什么？手动可以搜到