.... 木麻黄MYB家族基因表达谱分析及Go功能注释 根据转录组数据，作者分析了200mm Nacl不同处理时间下182个MYB基因的表达情况及功能注释信息。 6. MYB家族基因顺式作用元件分析 作者分析了182个MYB家族基因启动子区域顺式作用元...
...剪接、甲基化）影响性状.这里我们详细介绍一下非模式数据如何进行共定位分析 01 — 数据准备 首先需要做一个标准的leafcutter分析,得到每个样本的内含子表达量信息既然是共定位分析,必须要有的肯定是两个分析出来的结...
...14.日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决：1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做...
fastp是一款较新的数据质控软件，可以对测序数据进行处理。这里介绍如何对fastq文件进行剪切。 其命令如下: fastp --in1 data_yuanshi/Tres_2_1.clean.fq.gz --out1 Tres_2_1.clean.fq.gz --in2 data_yuanshi/Tres_2_2.clean.fq.gz --out2 Tres_2_2.clean.fq.gz --trim_...
你好，我对这个GEO2R分析时，数据分组不理解。 在GEO中检索出所有样品之后，选择Define groups，选定差异比较分组的样品（如果是多平台数据，请先确定平台）。在Define groups下拉输入框中，先输入control，点击Enter键，确定第一个...
...航，分别是：“文献·检索”、“科研·常备”、“常用数据库”、“生信·工具”、“生信·高级”、“自定义区域”、“科研技能”、“生活·常用”、“购物·休闲”。提供了4个搜索引擎：百度、谷歌、谷歌学术、百度学术...
此图是问题https://www.omicsclass.com/question/7725的GWAS图P-value的原始输入文件，红圈是最大值（但是对这个值进行曼哈顿图可视化后只有半个圆形）： 可视化的曼哈顿图：
...回答了一个网友的问题， 请问如何从无参转录组的fasta数据中，找到一些拟南芥的同源序列，比如拟南芥的LHY基因，在fasta数据中能找到吗？ 您建议拿目的基因和无参转录组组装得到的unigene进行blast，比对率高的可能就是同源...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...位点过滤 –snp <string>字符串的名称可以匹配dbSNP的数据，适合人类基因组，该指令可多次使用</string> –snps<filename> -exclude <filename> 包括或排除文件中给出的SNP列表 变异类型过滤 –keep-only-indels 只保留indel标记...
...济的选择，因为可以低成本获得大量的序列用于分析。 数据分析 作者取A. aureum and A. speciosu 的幼嫩叶片进行无参转录组测序，denovo分别组装构建unigene库；并对unigene库进行（Nr，KEGG，GO等）数据库注释；另外，测了...
fastp是一款数据质控软件，可以对测序数据进行处理。这里介绍如何对fastq文件进行剪切。 其命令如下: fastp --in1 data_yuanshi/Tres_2_1.clean.fq.gz --out1 Tres_2_1.clean.fq.gz --in2 data_yuanshi/Tres_2_2.clean.fq.gz --out2 Tres_2_2.clean.fq.gz --disable_adapter_tr...
...说明： -i 输入基因表达量文件，建议用TPM标准化之后的数据，如果是FPKM可以设置--tpm进行转换；第一列ID为基因NAME IDTCGA-D7-A74A-01A-11R-A32D-31TCGA-BR-7704-01A-11R-2055-13TCGA-VQ-A91N-01A-11R-A414-31TCGA-CD-A4MH-01A-11R-A251-31NUP5018.6550531.5923228.233822...
...进行检测，具有检测成本低、周期短、灵活、实验操作和数据分析简单等特点，是中高通量靶点检测实验室的最佳选择。该技术目前已在全球范围内得到广泛应用，覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病...