如何解决
... print("错误")}, finally = { print("这是最终的代码块，无论如何都会执行")})2. stopifnot()功能: stopifnot() 函数用于断言检查，确保给定的条件为真。如果条件不满足，则函数会产生错误。这是一种快捷的方式来保证函数的输入或状态...
...了两个分组，分别38和49份样本，就发了5分的文章，真是小投入大产出。参考文献：Qi Y, Wan Y, Li T, et al. Comparison of the Ocular Microbiomes of Dry Eye Patients With and Without Autoimmune Disease. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:716867. Published 2021 Sep 22. d...
...s的perl模块进行，但是这种方式对perl的要求较高，且操作比较复杂，这里我们选择使用Bcftools，操作简便。 分三步： 将vcf进行压缩，批量压缩的方法： bgzip -c -f -@ 10 merge.vcf > merge.vcf.gz -c, --stdout write on standard ...
...ools --vcf all.filter.vcf --plink --out aa ; –plink-tped –chrom-map 比较选项 DIFF VCF FILE –diff<filename></filename> –gzdiff<filename></filename> –diff-bcf<filename></filename> –diff-site –diff-indv –diff-site-discordance –diff-indv-disc...
R语言涉及的R包非常多，如何跟踪R包的更新进展或者新发布的R包，及时进行本地安装或版本迭代，可以参考下方链接，依据时间显示R包情况： http://lib.stat.cmu.edu/R/CRAN/web/packages/available_packages_by_date.html 或者可以通过名称显示...
...里我就不赘述了。 方法三：wget下载 前两种方法都能够比较快速稳定的下载SRA数据，小编通常用的也是第二种方法，但是偶尔也会遇到一些特殊的数据是下载不了的。这时候就需要这第三种方法了。首先在NCBI首页的SRA数据库检...
...性状是由大效应的位点控制，进行GWAS研究需要的样本量比较低，即使低于100也能检测到有意义的位点[26]。对于复杂性状由若干的微效基因控制，那么样本量至少要达到几千[32，33]。从现在的动植物的发表文章来看，GWAS研究的样...
...无法处理大量文件修改名称。 在处理大量文件的时候该如何进行批量修改呢？ 方法一：mv配合for循环方式进行修改 $ for name in `ls *.html`;do echo $name ${name%.html}.jpg;done00.html 00.jpg01.html 01.jpg02.html 02.jpg03.html 03.jpg04.html 04.jpg05.html 05....
...ll("limma", version = "3.8") 进行芯片数据预处理或标准化的包比较多，这里列举常见的几个 相关课程：GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4...
...型的获益都比极端曲线高，所以它们可选的阈值Pt范围都比较大，相对而言比较安全，可以结合实际的净收益情况去选择阈值的大小。本期干货内容有点多，对大家如果有一点点帮助，还请大家多多支持，关注我呀～今天就到这...
...标记下可更改图片大小，标注等 （4）在左侧选择要比较的分组，多组推荐ANOVA进行假设检验，两组样品推荐Welch’s t-test（非正态分布，方差不齐） 方法描述ANOVA（多组）用于检验多组均值是否相等的方法。可被认为是可...
...况下，生物实验室产生的废气相对较少，化学实验室倒是比较多，而且多具有毒性，因此需要严格分类、处理： 不免想起，曾经有学弟做实验室，使用苯酚和氯仿曾将实验室整个楼层弄得仙(乌)气(烟)袅(瘴)袅(气)...... 再来...
...荧光染料，通过流式细胞仪检测，与已知倍性的对照样品比较计算后可以获得DNA的倍性关系。 2. 测序数据分析 Smudgeplot： 从k-mer数据库中提取杂合k-mer对，然后训练这些杂合k-mer对。通过比较k-mer对覆盖度的总数CovA+CovB和相对覆...
...含有大量的非同义突变，而另外两个基因上的突变位点都比较少，所以基本可以确定，抗性特性应该与Bra019410和Bra019413相关。 为了科学的严谨，预测到的抗病基因还需要采用基因敲除的方法进行实验验证。 总...