介绍一款Pacbio 三代数据分析的软件 PRAPI， 该软件相关的文章为《PRAPI: post-transcriptional regulation analysis pipeline for Iso-Seq》,我们来看一下该软件的功能。 功能比较强大, 能分析的内容多，而且能结合二代和三代的数据一起分析...
... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
在理想的状态我们希望数据没有缺失值。不幸的是，由于各种原因，缺失值会时有发生。这会带来问题。无法在不完整的数据矩阵上进行聚类分析。 Husson和Josse写了一个称为missMDA的包，可以用imputePCA（）函数进行缺失值的填充...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...个差异基因，代谢组筛出一堆差异代谢物，可这些“零散数据”怎么串联起来？基因调控了哪个通路？通路又如何影响代谢物变化？“基因-通路-代谢物”的调控链条藏在海量数据里，靠表格罗列根本看不清逻辑…… 今天就给...
...权限设定的作用 文件权限的设定是为了保护系统及用户数据的安全性。对于用户来说，最重要的事情就是数据、文件的私密性及安全性。从系统管理员到普通用户，从文件属性到文件特殊加密，无不围绕着一个主题：权限管理...
重测序分析，当数据比对到参考基因组上，去重复并建立索引后，我们给的下一步是：对map结果进行QC分析，然后进行GATK的call SNP 对map结果进行QC分析，也没有根据这个结果对数据处理的流程 我看有的教程上是需要碱基质量...
...分析中，经常需要绘制多组学瀑布图，用于展示不同组学数据(如转录组学、蛋白组学、代谢组学等)在同一通路内不同类型分子的贡献差异。这种瀑布图可以直观呈现同一通路内各差异特征对组间差异的贡献强度，为快速锁定核...
...umina短读长和Hi-C染色质构象捕获技术，生成高质量基因组数据。最终的基因组大小为 266.23 Mb，锚定在8个染色体上，N50=31.6Mb，BUSCO完整度为98.9%，QV序列一致性打分为48.75。 02. 基因组注释 （1）重复序列注释 方法： LTR_Finder和 ...
在挖掘数据的时候发现有的数据用的是v2版本的,我手里只有全长的和v3-v4的,全长效果没那么好感觉,但是我好久没有看过qii2相关的东西了,有点忘了,刚好最近ai很火,我就尝试用ai帮我构建,过程如下 这里是完整的链接 https://w...
...7 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
ProteoWizard 是一套用于蛋白质组学数据分析和转换的开源软件工具，它支持多种质谱数据格式转换、可以用于谱图查看、质谱仪器参数查看、还可以用于蛋白序列模拟酶切…… ProteoWizard官网：https://proteowizard.sourceforge.io/ 一、软...
...突出文章亮点； 2. 生物信息分析类 自研算法、流程、数据可视化软件等； 3. 分子实验类 高通量测序、蛋白质组代谢组等上/下游实验技能等； 4. 科研笔记类 科研项目经验、论文写作技巧、生信学习心得等； 5. 资讯类 生...