找到约 15 条结果

问题 转录组上游分析之定量比对Hisat2出现内部异常错误

...里错了？如图下： 下面为上图的红圈error信息： Extra parameter(s) specified: "?/home/vip6/database/genome/Ensembl/Homo_sapiens/GRCh38_release104/Homo_sapiens.GRCh38_release104.genome" Note that if <mates&gt; files are specified using -1/-2, a <singles&gt; file cannot als...

文章 SNP不能转化成CAPS标记？来试试dCAPS吧！

...SNP位点，该位点不在限制性内切酶识别位点上。但若将TG（1 中绿色字体）改为CC，则该SNP位点将位于 BslI 限制性内切酶识别位点上。因此，通过引物引入错配的碱基CC,将构建限制性内切酶识别位点，酶切后通过琼脂糖或丙烯酰...

文章 导师放养，没有实验经费，该怎么办？

...是好导师，还是“坏”导师，其实都是相对而言的， 一个尽职尽责的好导师，可能会让你披星戴月全天候做实验； 一个基本不露面放养型的导师，可能会让你自由自在颗粒无收。 学霸姐姐这么多年来，真的听说了太多太多...

文章 GATK4

...通量测序数据中分析变异信息的软件，是目前最主流的snp calling 软件之一。GATK 设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据，随着不断发展，现在也可以用于其他的物种，还支持CNV和SV变异信息的检测。在官网上，提供...

问题 单细胞测序数据FindAllMaker查找不同Cluster的Marker基因时报错

#快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因 Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \  -p FindAllMarkers --test.use  DESeq2   --logfc.threshold 0.25 ，执行此代码后报错：Warning: When testing 20 versus all: every gene...

问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

....%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers/025fef2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports the requested API version

问题 blast2go注释，报错“Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom/JDOMException”，请问如何解决，详细一点

[root@iZ8vb8s8t9gi6cyewfy80bZ b2g4pipe]# java -jar blast2go.jar -in 122_cds_wanted.fa.tab -a -v -out 122_annot_result Blast2GO Pipeline Version 2.5.0 -------------------------------------- Hash for resource ec2go_19072011.txt of type ec created. 4003 associations loaded. Blast2GO build: 23092011 Ch...

文章 根据fastq ID列表，输出指定ID对应的双端或单端fastq文件

...get_id_fqgz.py [-h] input_fastq_gz output_file2，使用perl脚本根据这个id文件和原始数据生成所需的cleandatause Bio::SeqIO; use Bio::Seq; use Term::ProgressBar; if (@ARGV == 3) { my ($id_file, $fq1_file, $out1_file) = @ARGV; filter_fastq($id_file, $fq1_file, $out1_file); ...

文章 cactus下载

不同物种构建泛基因组的时候需要用到Progressive Cactus 参考文章：Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomic 下载： 软件github：https://github.com/ComparativeGenomicsToolkit/cactus 选择的是Pre-compiled Binaries Linux Tarball这个版本...

文章 华为敏捷项目管理实践分享

...的解决方案优势。研发的产品，被销售、部署到全球170多个国家和地区，服务于全世界1/3以上的人口，支撑了2016年同比增长30+%、达5000多亿元的销售额。 一、敏捷、 DevOps方法论介绍 敏捷开发模式，遵循万物生长的客观规律...

文章 生存分析的一些基本概念

...存时间有两种类型：完全数据 和 截尾数据。完全数据(complete data)指被观测对象从观察起点到出现终点事件所经历的时间。截尾数据(consored data)或删失数据，指在出现终点事件前，被观测对象的观测过程终止了死亡概率(mortality pr...

文章 《Python入门》（生信）视频课程

...程控制小汽车自动启停： 腾讯视频：https://v.qq.com/x/page/b01869g9mj5.html 组学大讲堂课程：https://www.omicsclass.com/course/33 Python编程异常流行 近年来人工智能、云计算、大数据分析飞速发展，这些行业首选编程语言就是Python；著名的...

文章 华科一教授论文抄袭：篮球论文抄足球论文，踢“篮球”你见过没？

...你什么奇葩的事情都会见到， 这不，这两天，就有一个很奇葩的新闻， 事情是这样的： 华中科技大学某副教授万某， 在2009年6月获得了湖北大学教育学硕士学位， 这位教授当时的硕士学位论文题目是：湖北省普通高校篮...

问题 你好，打扰了，想请教一下我是mac版R studio，安装WGCNA总报错，不太看得懂哪里出了问题，麻烦指导一下，急，谢谢！

&gt; install.packages("WGCNA") Package which is only available in source form, and may need compilation of C/C++/Fortran:   ‘WGCNA’ Do you want to attempt to install these from sources? (Yes/no/cancel) Yes installing the source package ‘WGCNA’ 试开URL’https://cran.rstudio.com/src...

问题 借助转录组辅助基因组注释

我在运行Launch_PASA_pipeline.pl -f FL_accs.txt -c alignAssembly.config -C -r -R -g genome.softmasked.fa -T -t all_transcripts.fasta.clean -u all_transcripts.fasta --CPU $threads --ALIGNERS blat,minimap2 --TRANSDECODER --TDN tdn.accs --MAX_INTRON_LENGTH 1000000 这步时报错， minimap2 ...