程序运行中无报错，但是输出的figtree里面分化时间是NAN。如下：UTREE 1 = (((Spermwhale: -nan, (Cow: -nan, Sheep: -nan)。我用seq模式和近似自然法都是同样的情况，我的序列是cds序列，我输入的树文件是：(((A,(C,S)'U(0.15)')'B(0.47,0.58)',((((B,LA),B...
做基因家族分析上游顺作用原件分析时，启动子序列提取结果现显示如下，请问是哪出错了
...色荧光)的信号，对早期凋亡和晚期凋亡的细胞比例进行分析。 实验中的小细节 一、如果可以，尽量选择活力旺盛的“青年”细胞 细胞凋亡想做好，细胞状态选择最重要。 为什么要选择活力旺盛的细胞?大家都知道生长代数...
老师，我购买了有参转录组分析课程，现在需要分析无参的，请问是不是无参的分析流程就是不用基因组比对这一步，直接进行转录组组装。按照有参课程就可以分析，还是说分析流程还有别的区别？ 谢谢
《基因家族分析 19年版》课程中关于基因家族共线性分析： 1、MCScanX和circos都可以做共线性分析，有区别吗？2、课时17：这两个文件是怎么得到的？
gene_list mscan结果 下面是KaKs分析结果 挑选出其中位于同一条染色体的 换成基因名字作图：只有三对
...外人看来一脸黑人问号的梗，在我们眼里也是心领神会、不言而喻...... 以下这些，不懂不是科研汪！！ 1、自我介绍 不要问我为什么辣么那么穷，没错我就是个科研搬砖民工， 你以为读了硕士读了博士就是搞科研吗? 见过...
组学大讲堂基因家族分析课程里给的脚本貌似只能提取EXON和INTRON，请问能给一个把UTR也提取出来的脚本吗？谢谢！ 编程太菜，一时半会儿琢磨不出来 T_T||| 我试了组学大讲堂之前提供的一个脚本貌似不行,.....https://www.omicsclass...
老师，我之前按照课程做泛基因家族分析中Ka/Ks分析，得到了密度分布图上，只显示107个基因（除去832个私有基因外，还有118个基因），然后我查看all_kaks文件，有很多的NA值，另外，还有一些值非常大，比如GRAS41 2128.0700 GRAS9 ...
...电脑都不能胜任（内存限制），只能做练习使用。如果要分析数据尽量选择内存多的台式机或者服务器。 组学大讲堂云服务器即买即用，避免安装软件的麻烦和内存限制： https://study.omicsclass.com/
老师，您好！我正在学习基因家族分析课程，利用MCscanX绘制共线性圈图 已经获得gff文件，collinearity文件 请问染色体信息文件family.ctl和基因家族信息文件gene_family.txt如何获取？ 您说过gene_family.txt是”基因家族信息文件，写为...
...串联重复基因出来的文件，genome.blocklink.txt我用的是McscanX分析出来的文件，这样可以么？ （因为我用McscanX分析后，再用get_tandem_gene.pl脚本筛选串联重复基因并未筛选到，所以我想用筛选串联重复章节的文件绘制基因家族内的串...
...条不同的 mRNA，最终翻译成不同的蛋白质。通常在转录组分析中，会进行可变剪切的分析。 1.可变剪切基本类型 rMATS 最经典的就是把可变剪切分成 5 种基本模式： 1.SE：外显子跳跃（Skipped Exon）某个外显子直接被跳过，不包含...