...，每种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MAF格式，该软件包就会尝试从TCGA源或任何内部研究中有效地汇总，分析，注释和可视化MAF文件. 使用说明： https://www.bioconducto...
...据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分...
... ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 -out gene_exon_info.gff”跑不出结果，之后手动筛选出来，却没有exon等，用GSDS也没有结构，请问这个是不是无法分析？谢谢！
(base) [@host132 NBS-LRR]$ ~/paircoil2 -win 28 zc102_NBS_FullSeq.fas Usage: paircoil2 [-win 21|28] <fasta_file> <output_file> 不出结果不报错，不知道哪里有问题
blast format： 5 = BLAST XML, 格式 相比于 6 格式 包含更多的信息内容，包括比对的序列信息，长度信息等等；接下来我们可以用bioperl包来解析，获取自己想要的信息； #!/usr/bin/perluse strict;use Bio::SearchIO;use Data::Dumper;my $fi ...
...处理，已经进行了前面的分析，polish也已经完成。得到的结果如下，请问哪个是需要二代数据矫正的呢？是直接将polish.bam文件转换成fasta，进行矫正?或者将LQ进行矫正，然后与HQ进行合并呢？
运行这个脚本后 没有出来结果 linux出来一个这个信息
...在swiss-model中，使用自己模板的方法进行三维结构预测，结果在上传文件的时候遇到以上的问题，请问怎么解决。 Chains A, B of the uploaded template do not start with residue no. 1. Will be renumbered.Chain A of the uploaded template contains multiple unordered...
...ist(fig=function() par(mar=c(2.1, 0.1, 4.1, 2.1)))) # 筛选出一部分结果，进行绘图 hits <- deg_mapped$STRING_id[1000] # 绘图 string_db$plot_network( hits,required_score =700) # 将所有的结果输出到文件，后面采用cytoscape 进行网络分析 info <- string_db$get...
...引samtools index align1.sorted.bam#提取比对到参考序列上的比对结果samtools view -bF 4 align1.sorted.bam > mapped1.bam#bam文件转化为fq文件samtools bam2fq mapped1.bam > 1.fastqgzip 1.fastq 2.三代数据比对 minimap2 #建索引minimap2 -d reads.min reads.fa -t 30#比...
我看了一下序列里面有出现M、G字母，而其他正常序列出现了几个N字母也可以正常出结果。
仔细研究了一下课程里面带的拟南芥的示例数据和格式没什么问题，但是运行之后输出的结果为空
...能力，一起涨姿势。 1、二八原则 巴列特定律：“总结果的80%是由总消耗时间中的20%所形成的。”按事情的“重要程度”编排事物优先次序的准则是建立子啊“重要的少数与琐碎的多数”的原理的基础上。 举例说明：80%...
...行后续作图时，用ChIPseeker包进行注释后发现与文献中的结果差别很大。应该如何处理。
...参考序列，把这些未比对上的序列和35S进行比对，得到的结果都是和35S完全吻合。 请问各位，bowtie2或者tophat2是否有参数，调整容错率，能够分离出来一半是35S，一半是水稻基因组的序列呢？ 先谢过各位