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文章 生命大数据

...程涵盖三大主题：Big Data for Life （生命大数据）、Cloud Computing for Omics（生物信息云计算）、Artificial Intelligence & Bio-Intelligence（人工智能与生物智能）。各大主题下又将有哪些不可错过的精彩演讲？会议的详细日程供您参考。 ...

文章 植物科学常用数据库和生物信息学工具

...源和分析平台，调查其使用频率和应用程度，可以为大家更好地开展科研工作提供便利。 News 通用数据库 http://bigd.big.ac.cn/databasecommons/ 国家基因库下属数据库，涵盖各种生物的全面公开可用的数据信息 https://www.ncbi.nlm.ni...

文章 细胞培养步骤梳理：细胞复苏、传代、冻存中的细节问题

...的细胞死亡，因此细胞的浓度应足够高，起始浓度106—107个/ml/管; 四、细胞的传代培养 细胞传代：细胞在培养过程中不断增殖，培养皿/瓶空间有限，当细胞接触过密，生长就会受到抑制，影响细胞状态，因此我们要把其中一...

文章 这本SCI期刊的录用率高达100%！！真相是......

...cular Histology对的，你没有看错，就是100%！数据来源于LetPub，What，这是本来者不拒的杂志吗???该不会是野鸡期刊吧？仔细一看，影响因子居然有2.937分!妥妥的正规SCI期刊，Springer Nature旗下的一本细胞生物学期刊，在190种细胞生物...

文章 GSDS网站docker镜像本地构建

...网站有时候打不开，可能服务器没有人维护，原网站：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php   备用网站：http://gsds.gao-lab.org/index.php  这里为了方便大家使用GSDS，绘制基因结构图，组学大讲堂免费提供一个镜像使大家可以在自己的电脑...

文章 perl语言标量SCALAR

...样：${var}ing          sh中$(ls)   2.转义字符  \t 表示tab空白 \n 表示换行符   3. \ 的作用 作用：转义字符 取消字符含义： 　　取消$的变量标识       print "the \$var is $var \n"; 　　取消双引号"             print "A quote \" in...

文章 项目管理实践｜项目管理到底该怎么做？

...者弄清项目的剩余时间，评估工作进度，调整工作任务，更好地把握项目的整体。 五、项目管理的意识 所以总结起来，我们形成了一套完整的方案： 第一步，确认项目的三大角色，记好每个角色的职能范围和需求； 第...

文章 linux使用ossutil下载阿里云数据

...提供了Windows版的ossutil软件，但数据量很大的时候例如100G+，用windows软件下载就太慢了。 这个软件也提供了Linux版，使用它在Linux上下载阿里云数据非常方便， 一、软件下载 软件下载地址：安装ossutil (aliyun.com) 如果有sudo权限...

文章 IF=4.3 | 衰老水稻种子的转录组代谢组联合分析

“ 2025年5月 BMC Plant Biology杂志发表了一篇题为“Transcriptome and metabolome analysis of senescent rice (Oryza sativa L.) seeds: insights into the mechanism of germination vigor and seedling morphogenesis”的转录组代谢组联合分析文章。” 01 — 研究背景 种...

文章 R高效数据处理包—reshape2 长数据 vs 宽数据

...使用reshape2包将宽型数据转换成长型数据，反之亦然。这个包也是由Hadley Wickham开发和维护的。 升级包 tidyr：https://www.omicsclass.com/article/1475 长数据 vs 宽数据 对于宽型数据，每列代表一个不同的变量。例如datasets包中的mtcars数...

问题 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

老师您好！我在使用gatks生成gvcf文件时，报错，想麻烦老师帮忙看看是什么原因导致的呢？命令：/opt/biosoft/gatk-4.4.0.0/gatk HaplotypeCaller -R genome.fasta -I LSL1.MD.bam -ERC GVCF -O LSL1_test.g.vcf --pcr-indel-model CONSERVATIVE --sample-ploidy 2 --min-base-qual...

文章 遗传图谱中各种作图群体介绍

...分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队，克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……，还有数以千计的硕博论文。基因定位的传统方法是使用人工分离群体进行QTL定位，我们在本文中重温一下分离群体（作图群体）的一些概念。 ...

文章 docker 工具高级用法

...些大家在使用docker工具分析数据是的高级用法，方便大家更好的使用docker工具。 问题1：有时候我们运行一条命令可能需要很长时间，在这个过程中无意间关闭了终端，我的任务还在运行吗？还可以继续吗？ 答：我们的任务还...

文章 生成OTU方法如何选择，OTU/ASV?

...OTU除了聚类的方法，还有降噪的方法。本文分析DADA2、Deblur、Unoise3共三种降噪方法的异同点。 1DADA2 Callahan等人在2016年推出DADA的更新版DADA2，文章发表在Nature Method上。文中对比了DADA2的方法和UPARSE聚类方法的得到OUT的效果（图1...

文章 杂交瘤技术制备单克隆抗体：详细流程与常见问题解析

杂交瘤技术是一种将B淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合生产单克隆抗体的传统方法。该技术通过将动物脾细胞与骨髓瘤细胞融合，产生永生化杂交瘤细胞系，然后筛选其上清液中的抗原特异性克隆，并进一步循环亚克隆以产生严格的...