...s <- gene_names Univar <- lapply(VarNames, Unicox) # 将单因素的结果汇总 Univar <- ldply(Univar, data.frame) 整理的结果如下： Characteristics Hazard.Ratio CI95 P.value 1 LINC01587 1.00 0.99-1.01 0.6771 2 XXbac_B461K10.4 1.01 1-1.03 0.0380 3...
...ge -G参考注释，得到合并的gtf文件后，用这个gtf去算fpkm，结果里有的trans id 是MSTRG。有人说是参考注释有问题，我是在ensembl plant上下载的gtf文件，好像没什么问题。 还有请问lncRNA分析，注释文件的gene id和trans id是自己预设，请...
...p3处理过的序列quercus(里面有418contigs)，不是应该出现产生结果文件序列名quercus.fasta.misa（以表格的形式列出微卫星的类型和位点）和quercus.fasta.statistics（统计微卫星的类型和频数），而是出现一堆txt格式的，contig1，contig1等等和q...
在用cafe的时候总是在最后一步报错，然后无法生成运行结果，如下图： 这个物种在我的输入文件和时间树里都是存在的。。。 我的脚本如下图
ka/ks和种内做圈图都是计算种内串联复制和片段复制的方式，它们俩的计算结果是不是应该一样的，近日发现KA/KS算出的和圈内表示出的，差别很大。
...据的全能选手，其功能覆盖了TCGA数据的下载，分析以及结果的可视化，具体的如下图所示 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》《TCGA-基因差异表达分析》《TCGA-转录因子调控》《TCGA-ceR...
...然每一个池只有十来个样品的实验，是否能够得到满意的结果，是存在一定风险的。 Q6：提取子代DNA时应当先混后提，还是先提后混？ A6：理想状态是将每个子代样品都单独提取DNA，然后根据DNA的浓度，等量均匀混合成一份DNA...
这是我提取出来的结果，不知道接下来如何分析
这是我的代码 这是运行结果，我都觉得奇怪了
...释，但是在参考书里没有找到这个词或相关章节。 通过搜索找到了： 1.分子连接性：指一个分子中各个骨架原子排列或连接的方式，它反映了分子结构的信息。分子连续性是研究分子结构和理化性质与生物活性之间定最关系(...
...有结构域缺失的序列想做做蛋白质全长多序列比对看看，结果发现序列缺失，如图：，但是前期在数据库看的时候确实有这个结构域如图，打开WRKY_pep_final_aligned文件后发现是这种情况：，但是其他序列比对后是，感觉是muscle -ali...
...果： library(scales) show_col(rainbow(10),labels=T) #labels控制是否显示HEX格式的色值信息. 接下来我用一个版面矩阵将五个色盘颜色全部显示出来： par(mfrow=c(1,5),mar=c(0.5,0.5,2,0.5),xaxs="i",yaxs="i") n<-1000 barplot(rep(1,times=n),col=rainbow(n),border...
...ly top 31563574 reads are used in downstream analysis.这个问题，组装结果中只有一条8000bp左右的序列，请问怎么设置参数才能不 only top reads进行后续分析，而能够使用全部reads进行后续分析
...群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 ...
...fuck.fa -d fuck.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o fuck.blast影响了结果。请老师解答一下这个问题，不胜感激！！！