问题 您好，我想问下如果我的基因家族有两个结构域，两个pfam号，我应该怎么筛选呢？？

问题 请问各位老师，E-value（e值）设定的根据是什么？对结构域筛选影响很大吗？

文章 利用Hiplot网站进行热图绘制

...介绍如何在Hiplot网站中绘制热图，只需要导入固定格式的数据文件，就可快速输出聚类热图。 绘制热图是Hiplot的基础模块功能之一，除此之外，也可以绘制转录组数据分析中常用的主成分分析图、气泡图、基因聚类图、火山图...

问题 请问筛选结构域之后进行的三大网站鉴定那，SMART能出结果，NCBI上筛不出来是怎么回事

问题 老师，想用ka/ks值画一个热图，而不是筛选大于1的基因做热图，请问如何修改代码及脚本？

文章 TCGA数据下载—TCGAbiolinks包参数详解

...建立的癌症研究项目，通过收集整理癌症相关的各种组学数据，提供了一个大型的，免费的癌症研究参考数据库。 官方提供了对应的下载工具Genomic Data Commons Datga Portal,  简称GDC, 网址如下:https://portal.gdc.cancer.gov/，挖掘里面的数...

问题 老师我在做KAKS分析时，生成的.axt文件对比序列不是三的倍数，我按操作手册的方法，提高的筛选条件，

... -in2 WRKY_cds_confirmed_blast.out -out duplication_gene.out，中提高的筛选条件，甚至我调高到90，输出的结果中还是包括不是三的倍数的比对序列，这种情况应该怎么办呢， 还有，同样的问题，由于基因组注释的问题，我的CDS序列没有起...

问题 我想问的是关于我鉴定到的基因家族，怎样筛选，怎样判断该基因家族拥有那个特定的结构域

问题 用CoNet进行OTU互作网络分析时如何筛选去网络中的关键节点、枢纽或者物种（network hubs）？

问题 使用基因家族特异的隐马尔科夫模型筛选过蛋白质组库以后，发现含有该保守结构域的

文章 芯片原始数据标准化的几个包的安装

芯片原始数据下载后进行质控标准化除了基于相关的软件外，也可以利用bioconductor的几个包，不过需要注意介于R版本的问题，包的安装基于install.packages可能安装不成功。 具体安装方法最好去网站查找R包和对应R版本，新老版本...

文章 快速解读：3-5分的蛋白质组学文章思路

...物、病原菌等逆境胁迫处理。 4、转录组测序推荐的测序数据量？ 转录组测序所需数据量与所研究物种的基因组大小有关，基因组越大，则所需数据量越大。按照我们的经验来说： 常规物种一般建议6G数据即可； 基因组较大...

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问题 老师您好，做基因家族鉴定分析时如何将网站上筛选的基因家族与自己的转录组鉴定得到的基因家族融合在一起？

问题 想问一下，为什么我用pfam筛选，结果出来是这样的，没有能看结果的地方，也没有能下载的地方