问题 请问老师，泛基因家族的数量是根据什么定的啊，如果说几个基因组共有的加上单个基因组独有的话，怎么还会有的基因不存在任何一个基因组呢？

文章 44家机构联合破解巨型鱿鱼基因组！

...7个反射素基因和3个类反射素基因，不过也没有进一步的分析了。  看完本文，小编还是有点失望，巨大体型没有找到基因组水平的解释，原钙粘蛋白和反射素也是头足纲共有的特性，关于巨型鱿鱼本身的亮点不多，还是希望后...

文章 当了项目经理,你才知道的10件事！

..."，谁当谁知道啊，可是没当过项目经理的你们，永远也不知道"坑"在哪里。 1、当了项目经理，你才知道，还是做技术的时候最简单。 因为技术的不确定性最小，业务和管理的不确定性太多，不确定性就意味着复杂，需要更多...

问题 共线性分析得出的基因对可以用于kaks分析吗？还是只有串联重复的基因对才可以用于kaks分析啊？

共线性分析得出的基因对可以用于kaks分析吗？还是只有串联重复的基因对才可以用于kaks分析啊？ 用blast得到的基因对都是串联重复基因吗？可以直接用于kaks分析吗？

问题 根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤

...下图），想请教老师平均覆盖度和比对率多少适合做后续分析呢？ 老师，我看之前的问答，gatk VariantFiltration做过滤会很慢，我的raw.vcf.gz文件有319G，我尝试了一下，18个小时了才得到1.1G的raw.gatk.vcf.gz文件 我的服务器是500G的，-...

问题 基因组里5UTR注释

您好！我想请问下数据库如NCBI里面的基因注释是通过算法预测的吗还是实验验证的？hg19与hg38同样的序列，但是在5UTR上的位置区域就不一样，这个区域不一样会导致启动子位置的选择也不一样。

文章 做基因定位？大家可能忽略了这个最熟悉的技术

...位点。基于两个极端表型库中突变位点与抗病表型的关联分析，在A03染色体上关联到一个4M的区域。  检阅下BSR的结果是不是靠谱？          在4M的关联区域，查找与抗病相关的功能基因，找到4个TIR-NBS-LRR家族的抗病基因...

文章 TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

一般的分析都是针对单一类型的分子进行分析，比如lncRNA, mRNA， miRNA 等，而文章《identifying mirna and gene modules of colon cancer associated with pathological stage by weighted gene co-expression network analysis》则结合Gene,miRNA 分别进行WGCNA的分析，获得...

问题 老师，请问一下，由于从NCBI下载的数据中的基因、蛋白和染色体名称的不同导致用你给的W.sh文件的脚本提取不出转录本ID，该怎么办？

问题 老师我做比较基因组的时候，准备文件阶段时用Ensembl 下载的基因组为什么跑不出来cds和蛋白质文件，跑出来的结果都是0kb

01.prepare_data.sh.o

问题 vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

vcf.gz是1.5G，等位基因过滤生成个900多B的文件，感觉不是想要的东西

文章 为什么“@微信官方”会突然刷爆朋友圈？如何打造一场爆款活动？

...动中，出现的所有文档和图片信息都可上传至文件，通过在线预览的模式可随时查阅。       总结   在这个广告无处不在的年代，用户也对品牌的营销有着更高的“戒备心”，但腾讯新闻能凭借这次给祖国庆生的机会突破...

文章 37门付费精品课程免费送！（此链接微信中打开体验更好）

...7门优质生信课程！！ 在国外大部分生命科研人都会生信分析，在国内，越来越多的科研人也开始尝试自己分析数据。 生信高手自己就抵得上一个团队，尤其在海量数据充盈网络的时代，用别人的数据，发自己的文章，用最少...

问题 请问在运行利用exprs()获取表达矩阵 exprSet = exprs(gset)时，报错Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘exprs’ for signature ‘"factor"’不知道什么原因？

请问在运行利用exprs()获取表达矩阵  exprSet = exprs(gset)时，报错Error in (function (classes, fdef, mtable)  :    unable to find an inherited method for function ‘exprs’ for signature ‘"factor"’不知道什么原因？

问题 我在构建进化树的时候，分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特点，但发现有的成员分类错误，采用ML法，校正参数Bootstrap设置为1 000次重复，结果出来后却发现，AtLC10本应该在第二组，AtLC13应该在第三组，但实际的结果恰恰相反，之后我又换了NJ法，结果还是不理想，依然有成员分组混乱，不知道我是哪里做的不对，希望得到指导。（AtLC10:AT5G01190.1,AtLC13:AT5G07130.1）