5 基因组里5UTR注释

您好!我想请问下数据库如NCBI里面的基因注释是通过算法预测的吗还是实验验证的?hg19与hg38同样的序列,但是在5UTR上的位置区域就不一样,这个区域不一样会导致启动子位置的选择也不一样。

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最佳答案 2018-07-31 10:00

1. NCBI数据库中,原核生物的基因一般采用电子注释,而真核生物的基因注释一般采用电子注释+转录组校正(实验验证)。

2. hg19 和hg38 基因的位置注释信息可能有不同,需要具体的看一下,提取序列是否有问题

3. 一个基因一般都含有多个不同的转录本,转录本的结构,可以按照是否能编码蛋白,分为3部分,分别是5‘UTR, CDS和3‘UTR。 所以,你在比较时,需要比较同一转录本,其5‘UTR是否一样。


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  • 默蓝 提出于 2018-07-15 12:19

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