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文章 Linux 服务器 安装Jupyter notebook 并开启远程访问

...password: ****** Verify password: ****** Out [2]: 'sha1:...' 复制Out [2] 显示的密码('sha1:...' 包括引号)。新版notebook7 用这个:from jupyter_server.auth import passwd3. 修改jupyter notebook的配置文件打开配置文件vim ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py 在该文件...

问题 泛基因家族分析-SV和基因表达量

fpkm_SV_to_draw.2.txt文件中,为啥结果是这样,基因ID对应同一个基因组,这不对吧。

文章 为什么大公司一定要使用 DevOps?

...司青睐的真正原因。想要了解更多DevOps解决方案,请百度搜索CORNERSTOEN官网了解体验!

文章 叶绿体基因做跨物种系统发育分析

...下载好基因序列后使用BLASTP对下载序列与所有样品转录组结果中的蛋白质序列(需合并为一个文件,注意要区分所属样品)进行比对,e-value =10−6 ,从比对结果中筛选在所有样品中都存在的叶绿体基因,并提取各样品中对应基...

问题 参考基因组比对,sam为空

老师我在建立好索引之后,与参考基因组比对失败了,sam文件都是空的,summe我的命令是这样的: --rna-strandness RF这个链特异性参数有没有都是一样的结果,请求老师帮助。

问题 smooth.value

在分析xpclr Rod 时候,我发现计算出的value 和  smooth.value 结果有差别,我想知道smooth.value 是怎么计算出来的? chrstartendvaluesmooth.value NC_062971.11100000-0.632539336016865-0.430585052618588 NC_062971.150001150000-0.632539336016865-0.433298065264543 NC_06297...

文章 circos改变某两条染色体之间的距离

..._size=45    radius=0.95r  #设置半径,以免基因名称过长超出显示范围    show_label=yes    <spacing>        default=0.005r        <pairwise chr01;chr12>            spacing= 10r        </pairwise>    </spacing>    stroke_color=dgrey...

问题 关于基因家族的鉴定

...blast,最后进行结构域验证的方法。最后发现鉴定出来的结果重复项很多,请问这样有问题吗?

问题 使用clusterProfiler进行富集时,无法生成图片

使用clusterProfiler对非模式生物进行GO/KEGG富集时,无法生成图片,最后只有一个白框。而且最终结果dim后发现也不正常,有没有大神知道这是怎么回事? 代码及详情见图片

文章 关于miRNA你知道多少?

...据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分...

文章 一大波三代文章正在来袭!有没有你滴?

...得到全长转录本,无需组装。能更好地改善基因表达定量结果,发现新的基因和转录异构体,鉴定可变剪切及基因融合现象。随着三代测序技术不断完善,通量越来越高,价格越来越低,近年来热度也越来越高,目测即将有一大...

问题 NBS基因家族进化树构建的时候,为什么有些同类(具有相同的结构域)如具有RPW8结构域的基因不是都聚在附近的一个分支上?

...在我们的鉴定过程中没有鉴定到?我看他们也只是用的HMM搜索,但是确实有些基因不存在于我们的HMM搜索的基因中,哪怕是建立特异模型后。请问这是什么原因。怎么才能将这些同类的基因聚到一起

文章 USB挂载到KVM虚拟机

...o udevadm trigger 确认权限 ls -l /dev/bus/usb/002/002 应该显示 crw-rw-rw-,普通用户就可以访问了。 重启虚拟机 virsh start k10 卸载: 登陆宿主机 # 如果有挂载点,先卸载sudo umount /dev/sdX1# 或者通过挂载点卸载sudo umount /mnt/...

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师您好。我的泛基因组为15个品系基因组构成,参考基因组为JG。为啥我WRKY_gene_fpkm.filter.xls的结果缺少SD和RA品系的呢?

文章 华科一教授论文抄袭:篮球论文抄足球论文,踢“篮球”你见过没?

...高校篮球队现状调查与发展对策研究, 然而,查重系统显示,万某的这篇论文复制比高达81.5%!! 基本就是完全复制粘贴了呀!! 这还不算! 奇葩的是:万教授这篇讲篮球的论文,抄袭的是别人讲足球的论文, 你抄就好好...